Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gdpd3Q99LY2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gdpd3Q99LY2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gdpd3Q99LY2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gdpd3Q99LY2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gdpd3Q99LY2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gdpd3Q99LY2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gdpd3Q99LY2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gdpd3Q99LY2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gdpd3Q99LY2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gdpd3Q99LY2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gdpd3Q99LY2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gdpd3Q99LY2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gdpd3Q99LY2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gdpd3Q99LY2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gdpd3Q99LY2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gdpd3Q99LY2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gdpd3Q99LY2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gdpd3Q99LY2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gdpd3Q99LY2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gdpd3Q99LY2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gdpd3Q99LY2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gdpd3Q99LY2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gdpd3Q99LY2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gdpd3Q99LY2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gdpd3Q99LY2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gdpd3Q99LY2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gdpd3Q99LY2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gdpd3Q99LY2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gdpd3Q99LY2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gdpd3Q99LY2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gdpd3Q99LY2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gdpd3Q99LY2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gdpd3Q99LY2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gdpd3Q99LY2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gdpd3Q99LY2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gdpd3Q99LY2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gdpd3Q99LY2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gdpd3Q99LY2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gdpd3Q99LY2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gdpd3Q99LY2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gdpd3Q99LY2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gdpd3Q99LY2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gdpd3Q99LY2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gdpd3Q99LY2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gdpd3Q99LY2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gdpd3Q99LY2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gdpd3Q99LY2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gdpd3Q99LY2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gdpd3Q99LY2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gdpd3Q99LY2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gdpd3Q99LY2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gdpd3Q99LY2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gdpd3Q99LY2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gdpd3Q99LY2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gdpd3Q99LY2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gdpd3Q99LY2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gdpd3Q99LY2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gdpd3Q99LY2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gdpd3Q99LY2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gdpd3Q99LY2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gdpd3Q99LY2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Gdpd3Q99LY2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gdpd3Q99LY2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Gdpd3Q99LY2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gdpd3Q99LY2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gdpd3Q99LY2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gdpd3Q99LY2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gdpd3Q99LY2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gdpd3Q99LY2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gdpd3Q99LY2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gdpd3Q99LY2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gdpd3Q99LY2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gdpd3Q99LY2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gdpd3Q99LY2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gdpd3Q99LY2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gdpd3Q99LY2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gdpd3Q99LY2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gdpd3Q99LY2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gdpd3Q99LY2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gdpd3Q99LY2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gdpd3Q99LY2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gdpd3Q99LY2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gdpd3Q99LY2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gdpd3Q99LY2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gdpd3Q99LY2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gdpd3Q99LY2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Gdpd3Q99LY2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gdpd3Q99LY2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gdpd3Q99LY2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gdpd3Q99LY2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gdpd3Q99LY2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gdpd3Q99LY2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gdpd3Q99LY2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gdpd3Q99LY2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gdpd3Q99LY2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gdpd3Q99LY2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Gdpd3Q99LY2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gdpd3Q99LY2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gdpd3Q99LY2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms