Protein–RNA interactions for Protein: Q99KC8

Vwa5a, von Willebrand factor A domain-containing protein 5A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa5aQ99KC8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Vwa5aQ99KC8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Vwa5aQ99KC8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Vwa5aQ99KC8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Vwa5aQ99KC8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Vwa5aQ99KC8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Vwa5aQ99KC8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Vwa5aQ99KC8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Vwa5aQ99KC8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Vwa5aQ99KC8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Vwa5aQ99KC8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Vwa5aQ99KC8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Vwa5aQ99KC8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Vwa5aQ99KC8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Vwa5aQ99KC8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Vwa5aQ99KC8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Vwa5aQ99KC8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Vwa5aQ99KC8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Vwa5aQ99KC8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Vwa5aQ99KC8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Vwa5aQ99KC8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Vwa5aQ99KC8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Vwa5aQ99KC8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Vwa5aQ99KC8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Vwa5aQ99KC8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Vwa5aQ99KC8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Vwa5aQ99KC8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Vwa5aQ99KC8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Vwa5aQ99KC8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Vwa5aQ99KC8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Vwa5aQ99KC8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Vwa5aQ99KC8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Vwa5aQ99KC8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Vwa5aQ99KC8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Vwa5aQ99KC8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Vwa5aQ99KC8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Vwa5aQ99KC8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Vwa5aQ99KC8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Vwa5aQ99KC8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Vwa5aQ99KC8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Vwa5aQ99KC8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Vwa5aQ99KC8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Vwa5aQ99KC8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Vwa5aQ99KC8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Vwa5aQ99KC8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Vwa5aQ99KC8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Vwa5aQ99KC8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Vwa5aQ99KC8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Vwa5aQ99KC8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Vwa5aQ99KC8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Vwa5aQ99KC8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Vwa5aQ99KC8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Vwa5aQ99KC8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Vwa5aQ99KC8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Vwa5aQ99KC8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Vwa5aQ99KC8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Vwa5aQ99KC8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Vwa5aQ99KC8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Vwa5aQ99KC8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Vwa5aQ99KC8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Vwa5aQ99KC8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Vwa5aQ99KC8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Vwa5aQ99KC8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Vwa5aQ99KC8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Vwa5aQ99KC8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Vwa5aQ99KC8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Vwa5aQ99KC8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Vwa5aQ99KC8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Vwa5aQ99KC8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Vwa5aQ99KC8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Vwa5aQ99KC8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Vwa5aQ99KC8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Vwa5aQ99KC8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Vwa5aQ99KC8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Vwa5aQ99KC8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Vwa5aQ99KC8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Vwa5aQ99KC8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Vwa5aQ99KC8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Vwa5aQ99KC8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Vwa5aQ99KC8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Vwa5aQ99KC8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Vwa5aQ99KC8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Vwa5aQ99KC8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Vwa5aQ99KC8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Vwa5aQ99KC8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Vwa5aQ99KC8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Vwa5aQ99KC8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Vwa5aQ99KC8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Vwa5aQ99KC8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Vwa5aQ99KC8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Vwa5aQ99KC8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Vwa5aQ99KC8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Vwa5aQ99KC8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Vwa5aQ99KC8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Vwa5aQ99KC8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Vwa5aQ99KC8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Vwa5aQ99KC8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Vwa5aQ99KC8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Vwa5aQ99KC8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Vwa5aQ99KC8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms