Protein–RNA interactions for Protein: Q921I9

Exosc4, Exosome complex component RRP41, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc4Q921I9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Exosc4Q921I9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Exosc4Q921I9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Exosc4Q921I9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Exosc4Q921I9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Exosc4Q921I9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Exosc4Q921I9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Exosc4Q921I9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Exosc4Q921I9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Exosc4Q921I9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Exosc4Q921I9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Exosc4Q921I9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Exosc4Q921I9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Exosc4Q921I9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Exosc4Q921I9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Exosc4Q921I9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Exosc4Q921I9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Exosc4Q921I9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Exosc4Q921I9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Exosc4Q921I9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Exosc4Q921I9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Exosc4Q921I9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Exosc4Q921I9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Exosc4Q921I9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Exosc4Q921I9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Exosc4Q921I9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Exosc4Q921I9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Exosc4Q921I9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Exosc4Q921I9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Exosc4Q921I9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Exosc4Q921I9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Exosc4Q921I9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Exosc4Q921I9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Exosc4Q921I9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Exosc4Q921I9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Exosc4Q921I9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Exosc4Q921I9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Exosc4Q921I9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Exosc4Q921I9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Exosc4Q921I9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Exosc4Q921I9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Exosc4Q921I9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Exosc4Q921I9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Exosc4Q921I9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Exosc4Q921I9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Exosc4Q921I9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Exosc4Q921I9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Exosc4Q921I9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Exosc4Q921I9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Exosc4Q921I9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Exosc4Q921I9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Exosc4Q921I9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Exosc4Q921I9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Exosc4Q921I9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Exosc4Q921I9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Exosc4Q921I9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Exosc4Q921I9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Exosc4Q921I9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Exosc4Q921I9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Exosc4Q921I9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Exosc4Q921I9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Exosc4Q921I9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Exosc4Q921I9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Exosc4Q921I9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Exosc4Q921I9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Exosc4Q921I9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Exosc4Q921I9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Exosc4Q921I9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Exosc4Q921I9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Exosc4Q921I9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Exosc4Q921I9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Exosc4Q921I9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Exosc4Q921I9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Exosc4Q921I9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Exosc4Q921I9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Exosc4Q921I9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Exosc4Q921I9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Exosc4Q921I9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Exosc4Q921I9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Exosc4Q921I9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Exosc4Q921I9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Exosc4Q921I9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Exosc4Q921I9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Exosc4Q921I9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Exosc4Q921I9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Exosc4Q921I9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Exosc4Q921I9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Exosc4Q921I9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Exosc4Q921I9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Exosc4Q921I9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Exosc4Q921I9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Exosc4Q921I9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Exosc4Q921I9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Exosc4Q921I9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Exosc4Q921I9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Exosc4Q921I9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Exosc4Q921I9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Exosc4Q921I9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Exosc4Q921I9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Exosc4Q921I9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms