Protein–RNA interactions for Protein: Q920F6

Smc1b, Structural maintenance of chromosomes protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1bQ920F6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Smc1bQ920F6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Smc1bQ920F6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Smc1bQ920F6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Smc1bQ920F6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Smc1bQ920F6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Smc1bQ920F6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Smc1bQ920F6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Smc1bQ920F6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Smc1bQ920F6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Smc1bQ920F6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Smc1bQ920F6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Smc1bQ920F6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Smc1bQ920F6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Smc1bQ920F6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Smc1bQ920F6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Smc1bQ920F6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Smc1bQ920F6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Smc1bQ920F6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Smc1bQ920F6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Smc1bQ920F6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Smc1bQ920F6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Smc1bQ920F6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Smc1bQ920F6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Smc1bQ920F6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Smc1bQ920F6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Smc1bQ920F6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Smc1bQ920F6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Smc1bQ920F6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Smc1bQ920F6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Smc1bQ920F6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Smc1bQ920F6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Smc1bQ920F6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Smc1bQ920F6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Smc1bQ920F6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Smc1bQ920F6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Smc1bQ920F6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Smc1bQ920F6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Smc1bQ920F6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Smc1bQ920F6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Smc1bQ920F6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Smc1bQ920F6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Smc1bQ920F6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Smc1bQ920F6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Smc1bQ920F6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Smc1bQ920F6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Smc1bQ920F6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Smc1bQ920F6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Smc1bQ920F6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Smc1bQ920F6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Smc1bQ920F6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Smc1bQ920F6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Smc1bQ920F6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Smc1bQ920F6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Smc1bQ920F6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Smc1bQ920F6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Smc1bQ920F6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Smc1bQ920F6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Smc1bQ920F6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Smc1bQ920F6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Smc1bQ920F6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Smc1bQ920F6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Smc1bQ920F6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Smc1bQ920F6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Smc1bQ920F6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Smc1bQ920F6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Smc1bQ920F6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Smc1bQ920F6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Smc1bQ920F6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Smc1bQ920F6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Smc1bQ920F6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Smc1bQ920F6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Smc1bQ920F6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Smc1bQ920F6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Smc1bQ920F6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Smc1bQ920F6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Smc1bQ920F6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Smc1bQ920F6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Smc1bQ920F6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Smc1bQ920F6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Smc1bQ920F6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Smc1bQ920F6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Smc1bQ920F6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Smc1bQ920F6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Smc1bQ920F6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Smc1bQ920F6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Smc1bQ920F6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Smc1bQ920F6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Smc1bQ920F6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Smc1bQ920F6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Smc1bQ920F6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Smc1bQ920F6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Smc1bQ920F6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Smc1bQ920F6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Smc1bQ920F6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Smc1bQ920F6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Smc1bQ920F6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Smc1bQ920F6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Smc1bQ920F6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Smc1bQ920F6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.8 ms