Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZU9

Grin3b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin3bQ91ZU9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Grin3bQ91ZU9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Grin3bQ91ZU9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Grin3bQ91ZU9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Grin3bQ91ZU9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Grin3bQ91ZU9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Grin3bQ91ZU9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Grin3bQ91ZU9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Grin3bQ91ZU9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Grin3bQ91ZU9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Grin3bQ91ZU9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Grin3bQ91ZU9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Grin3bQ91ZU9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Grin3bQ91ZU9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Grin3bQ91ZU9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Grin3bQ91ZU9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Grin3bQ91ZU9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Grin3bQ91ZU9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Grin3bQ91ZU9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Grin3bQ91ZU9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Grin3bQ91ZU9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Grin3bQ91ZU9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Grin3bQ91ZU9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Grin3bQ91ZU9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Grin3bQ91ZU9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Grin3bQ91ZU9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Grin3bQ91ZU9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Grin3bQ91ZU9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Grin3bQ91ZU9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Grin3bQ91ZU9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Grin3bQ91ZU9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Grin3bQ91ZU9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Grin3bQ91ZU9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Grin3bQ91ZU9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Grin3bQ91ZU9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Grin3bQ91ZU9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Grin3bQ91ZU9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Grin3bQ91ZU9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Grin3bQ91ZU9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Grin3bQ91ZU9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Grin3bQ91ZU9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Grin3bQ91ZU9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Grin3bQ91ZU9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Grin3bQ91ZU9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Grin3bQ91ZU9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Grin3bQ91ZU9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Grin3bQ91ZU9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Grin3bQ91ZU9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Grin3bQ91ZU9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Grin3bQ91ZU9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Grin3bQ91ZU9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Grin3bQ91ZU9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Grin3bQ91ZU9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Grin3bQ91ZU9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Grin3bQ91ZU9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Grin3bQ91ZU9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Grin3bQ91ZU9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Grin3bQ91ZU9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Grin3bQ91ZU9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Grin3bQ91ZU9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Grin3bQ91ZU9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Grin3bQ91ZU9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Grin3bQ91ZU9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Grin3bQ91ZU9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Grin3bQ91ZU9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Grin3bQ91ZU9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Grin3bQ91ZU9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Grin3bQ91ZU9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Grin3bQ91ZU9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Grin3bQ91ZU9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Grin3bQ91ZU9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Grin3bQ91ZU9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Grin3bQ91ZU9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Grin3bQ91ZU9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Grin3bQ91ZU9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Grin3bQ91ZU9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Grin3bQ91ZU9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Grin3bQ91ZU9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Grin3bQ91ZU9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Grin3bQ91ZU9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Grin3bQ91ZU9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Grin3bQ91ZU9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Grin3bQ91ZU9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Grin3bQ91ZU9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Grin3bQ91ZU9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Grin3bQ91ZU9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Grin3bQ91ZU9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Grin3bQ91ZU9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Grin3bQ91ZU9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Grin3bQ91ZU9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Grin3bQ91ZU9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Grin3bQ91ZU9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Grin3bQ91ZU9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Grin3bQ91ZU9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Grin3bQ91ZU9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Grin3bQ91ZU9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Grin3bQ91ZU9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Grin3bQ91ZU9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Grin3bQ91ZU9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Grin3bQ91ZU9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms