Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pde6cQ91ZQ1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pde6cQ91ZQ1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pde6cQ91ZQ1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pde6cQ91ZQ1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pde6cQ91ZQ1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pde6cQ91ZQ1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pde6cQ91ZQ1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pde6cQ91ZQ1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pde6cQ91ZQ1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pde6cQ91ZQ1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pde6cQ91ZQ1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pde6cQ91ZQ1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pde6cQ91ZQ1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pde6cQ91ZQ1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pde6cQ91ZQ1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pde6cQ91ZQ1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Pde6cQ91ZQ1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pde6cQ91ZQ1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pde6cQ91ZQ1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pde6cQ91ZQ1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Pde6cQ91ZQ1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Pde6cQ91ZQ1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pde6cQ91ZQ1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pde6cQ91ZQ1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pde6cQ91ZQ1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pde6cQ91ZQ1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Pde6cQ91ZQ1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Pde6cQ91ZQ1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pde6cQ91ZQ1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Pde6cQ91ZQ1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pde6cQ91ZQ1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pde6cQ91ZQ1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pde6cQ91ZQ1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pde6cQ91ZQ1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pde6cQ91ZQ1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pde6cQ91ZQ1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pde6cQ91ZQ1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pde6cQ91ZQ1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Pde6cQ91ZQ1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Pde6cQ91ZQ1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pde6cQ91ZQ1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pde6cQ91ZQ1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pde6cQ91ZQ1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pde6cQ91ZQ1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pde6cQ91ZQ1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pde6cQ91ZQ1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pde6cQ91ZQ1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pde6cQ91ZQ1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pde6cQ91ZQ1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pde6cQ91ZQ1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pde6cQ91ZQ1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pde6cQ91ZQ1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pde6cQ91ZQ1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pde6cQ91ZQ1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pde6cQ91ZQ1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pde6cQ91ZQ1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Pde6cQ91ZQ1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pde6cQ91ZQ1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pde6cQ91ZQ1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pde6cQ91ZQ1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Pde6cQ91ZQ1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pde6cQ91ZQ1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pde6cQ91ZQ1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pde6cQ91ZQ1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Pde6cQ91ZQ1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pde6cQ91ZQ1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pde6cQ91ZQ1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pde6cQ91ZQ1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pde6cQ91ZQ1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pde6cQ91ZQ1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pde6cQ91ZQ1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pde6cQ91ZQ1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pde6cQ91ZQ1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pde6cQ91ZQ1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pde6cQ91ZQ1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pde6cQ91ZQ1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pde6cQ91ZQ1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pde6cQ91ZQ1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pde6cQ91ZQ1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pde6cQ91ZQ1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pde6cQ91ZQ1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pde6cQ91ZQ1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pde6cQ91ZQ1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pde6cQ91ZQ1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pde6cQ91ZQ1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Pde6cQ91ZQ1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pde6cQ91ZQ1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pde6cQ91ZQ1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pde6cQ91ZQ1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pde6cQ91ZQ1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pde6cQ91ZQ1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pde6cQ91ZQ1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pde6cQ91ZQ1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pde6cQ91ZQ1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pde6cQ91ZQ1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pde6cQ91ZQ1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pde6cQ91ZQ1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pde6cQ91ZQ1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pde6cQ91ZQ1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
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