Protein–RNA interactions for Protein: Q91YU3

Msantd4, Myb/SANT-like DNA-binding domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msantd4Q91YU3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Msantd4Q91YU3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Msantd4Q91YU3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Msantd4Q91YU3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Msantd4Q91YU3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Msantd4Q91YU3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Msantd4Q91YU3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Msantd4Q91YU3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Msantd4Q91YU3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Msantd4Q91YU3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Msantd4Q91YU3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Msantd4Q91YU3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Msantd4Q91YU3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Msantd4Q91YU3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Msantd4Q91YU3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Msantd4Q91YU3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Msantd4Q91YU3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Msantd4Q91YU3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Msantd4Q91YU3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Msantd4Q91YU3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Msantd4Q91YU3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Msantd4Q91YU3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Msantd4Q91YU3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Msantd4Q91YU3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Msantd4Q91YU3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Msantd4Q91YU3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Msantd4Q91YU3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Msantd4Q91YU3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Msantd4Q91YU3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Msantd4Q91YU3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Msantd4Q91YU3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Msantd4Q91YU3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Msantd4Q91YU3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Msantd4Q91YU3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Msantd4Q91YU3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Msantd4Q91YU3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Msantd4Q91YU3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Msantd4Q91YU3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Msantd4Q91YU3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Msantd4Q91YU3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Msantd4Q91YU3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Msantd4Q91YU3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Msantd4Q91YU3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Msantd4Q91YU3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Msantd4Q91YU3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Msantd4Q91YU3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Msantd4Q91YU3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Msantd4Q91YU3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Msantd4Q91YU3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Msantd4Q91YU3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Msantd4Q91YU3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Msantd4Q91YU3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Msantd4Q91YU3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Msantd4Q91YU3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Msantd4Q91YU3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Msantd4Q91YU3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Msantd4Q91YU3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Msantd4Q91YU3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Msantd4Q91YU3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Msantd4Q91YU3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Msantd4Q91YU3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Msantd4Q91YU3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Msantd4Q91YU3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Msantd4Q91YU3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Msantd4Q91YU3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Msantd4Q91YU3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Msantd4Q91YU3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Msantd4Q91YU3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Msantd4Q91YU3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Msantd4Q91YU3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Msantd4Q91YU3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Msantd4Q91YU3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Msantd4Q91YU3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Msantd4Q91YU3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Msantd4Q91YU3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Msantd4Q91YU3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Msantd4Q91YU3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Msantd4Q91YU3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Msantd4Q91YU3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Msantd4Q91YU3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Msantd4Q91YU3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Msantd4Q91YU3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Msantd4Q91YU3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Msantd4Q91YU3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Msantd4Q91YU3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Msantd4Q91YU3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Msantd4Q91YU3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Msantd4Q91YU3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Msantd4Q91YU3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Msantd4Q91YU3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Msantd4Q91YU3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Msantd4Q91YU3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Msantd4Q91YU3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Msantd4Q91YU3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Msantd4Q91YU3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Msantd4Q91YU3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Msantd4Q91YU3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Msantd4Q91YU3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Msantd4Q91YU3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Msantd4Q91YU3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms