Protein–RNA interactions for Protein: Q91YJ2

Snx4, Sorting nexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx4Q91YJ2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snx4Q91YJ2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Snx4Q91YJ2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snx4Q91YJ2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snx4Q91YJ2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snx4Q91YJ2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Snx4Q91YJ2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snx4Q91YJ2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snx4Q91YJ2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx4Q91YJ2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx4Q91YJ2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx4Q91YJ2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snx4Q91YJ2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snx4Q91YJ2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snx4Q91YJ2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snx4Q91YJ2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snx4Q91YJ2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx4Q91YJ2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx4Q91YJ2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snx4Q91YJ2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Snx4Q91YJ2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Snx4Q91YJ2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx4Q91YJ2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx4Q91YJ2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx4Q91YJ2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx4Q91YJ2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx4Q91YJ2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx4Q91YJ2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx4Q91YJ2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx4Q91YJ2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx4Q91YJ2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx4Q91YJ2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx4Q91YJ2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snx4Q91YJ2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snx4Q91YJ2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snx4Q91YJ2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snx4Q91YJ2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snx4Q91YJ2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snx4Q91YJ2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx4Q91YJ2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx4Q91YJ2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx4Q91YJ2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx4Q91YJ2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx4Q91YJ2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx4Q91YJ2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx4Q91YJ2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx4Q91YJ2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx4Q91YJ2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snx4Q91YJ2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx4Q91YJ2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx4Q91YJ2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx4Q91YJ2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx4Q91YJ2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx4Q91YJ2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx4Q91YJ2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx4Q91YJ2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snx4Q91YJ2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snx4Q91YJ2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snx4Q91YJ2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snx4Q91YJ2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx4Q91YJ2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx4Q91YJ2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx4Q91YJ2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx4Q91YJ2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx4Q91YJ2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx4Q91YJ2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx4Q91YJ2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx4Q91YJ2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx4Q91YJ2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx4Q91YJ2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx4Q91YJ2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx4Q91YJ2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx4Q91YJ2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx4Q91YJ2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx4Q91YJ2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx4Q91YJ2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx4Q91YJ2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx4Q91YJ2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx4Q91YJ2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx4Q91YJ2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx4Q91YJ2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx4Q91YJ2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx4Q91YJ2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx4Q91YJ2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx4Q91YJ2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx4Q91YJ2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx4Q91YJ2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx4Q91YJ2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx4Q91YJ2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx4Q91YJ2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx4Q91YJ2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx4Q91YJ2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx4Q91YJ2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx4Q91YJ2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx4Q91YJ2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx4Q91YJ2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx4Q91YJ2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx4Q91YJ2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx4Q91YJ2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx4Q91YJ2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms