Protein–RNA interactions for Protein: Q91X17

Umod, Uromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UmodQ91X17 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UmodQ91X17 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UmodQ91X17 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UmodQ91X17 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UmodQ91X17 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UmodQ91X17 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UmodQ91X17 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UmodQ91X17 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UmodQ91X17 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UmodQ91X17 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
UmodQ91X17 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UmodQ91X17 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
UmodQ91X17 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
UmodQ91X17 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
UmodQ91X17 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UmodQ91X17 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UmodQ91X17 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UmodQ91X17 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UmodQ91X17 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UmodQ91X17 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UmodQ91X17 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UmodQ91X17 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UmodQ91X17 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UmodQ91X17 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UmodQ91X17 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UmodQ91X17 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UmodQ91X17 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UmodQ91X17 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UmodQ91X17 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UmodQ91X17 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UmodQ91X17 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UmodQ91X17 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UmodQ91X17 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UmodQ91X17 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UmodQ91X17 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
UmodQ91X17 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UmodQ91X17 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UmodQ91X17 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UmodQ91X17 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UmodQ91X17 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UmodQ91X17 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
UmodQ91X17 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UmodQ91X17 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UmodQ91X17 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UmodQ91X17 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UmodQ91X17 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UmodQ91X17 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UmodQ91X17 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UmodQ91X17 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UmodQ91X17 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UmodQ91X17 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UmodQ91X17 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UmodQ91X17 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
UmodQ91X17 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UmodQ91X17 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UmodQ91X17 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UmodQ91X17 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
UmodQ91X17 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UmodQ91X17 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UmodQ91X17 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UmodQ91X17 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UmodQ91X17 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UmodQ91X17 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UmodQ91X17 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UmodQ91X17 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UmodQ91X17 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UmodQ91X17 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UmodQ91X17 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UmodQ91X17 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UmodQ91X17 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UmodQ91X17 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UmodQ91X17 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UmodQ91X17 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UmodQ91X17 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UmodQ91X17 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
UmodQ91X17 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UmodQ91X17 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UmodQ91X17 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UmodQ91X17 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UmodQ91X17 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UmodQ91X17 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
UmodQ91X17 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UmodQ91X17 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UmodQ91X17 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UmodQ91X17 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UmodQ91X17 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UmodQ91X17 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UmodQ91X17 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UmodQ91X17 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UmodQ91X17 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UmodQ91X17 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UmodQ91X17 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UmodQ91X17 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UmodQ91X17 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
UmodQ91X17 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UmodQ91X17 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UmodQ91X17 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
UmodQ91X17 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UmodQ91X17 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UmodQ91X17 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms