Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Tdrd3Q91W18 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tdrd3Q91W18 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tdrd3Q91W18 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tdrd3Q91W18 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tdrd3Q91W18 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tdrd3Q91W18 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Tdrd3Q91W18 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Tdrd3Q91W18 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Tdrd3Q91W18 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Tdrd3Q91W18 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Tdrd3Q91W18 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tdrd3Q91W18 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Tdrd3Q91W18 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tdrd3Q91W18 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Tdrd3Q91W18 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tdrd3Q91W18 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tdrd3Q91W18 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tdrd3Q91W18 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tdrd3Q91W18 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tdrd3Q91W18 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tdrd3Q91W18 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tdrd3Q91W18 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tdrd3Q91W18 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tdrd3Q91W18 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tdrd3Q91W18 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tdrd3Q91W18 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Tdrd3Q91W18 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tdrd3Q91W18 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Tdrd3Q91W18 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tdrd3Q91W18 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tdrd3Q91W18 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Tdrd3Q91W18 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Tdrd3Q91W18 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Tdrd3Q91W18 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tdrd3Q91W18 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Tdrd3Q91W18 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tdrd3Q91W18 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tdrd3Q91W18 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tdrd3Q91W18 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tdrd3Q91W18 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tdrd3Q91W18 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tdrd3Q91W18 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tdrd3Q91W18 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Tdrd3Q91W18 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tdrd3Q91W18 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tdrd3Q91W18 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tdrd3Q91W18 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tdrd3Q91W18 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tdrd3Q91W18 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tdrd3Q91W18 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tdrd3Q91W18 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tdrd3Q91W18 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tdrd3Q91W18 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tdrd3Q91W18 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tdrd3Q91W18 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tdrd3Q91W18 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tdrd3Q91W18 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tdrd3Q91W18 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tdrd3Q91W18 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tdrd3Q91W18 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Tdrd3Q91W18 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tdrd3Q91W18 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tdrd3Q91W18 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tdrd3Q91W18 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tdrd3Q91W18 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tdrd3Q91W18 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tdrd3Q91W18 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tdrd3Q91W18 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Tdrd3Q91W18 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Tdrd3Q91W18 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tdrd3Q91W18 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tdrd3Q91W18 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tdrd3Q91W18 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tdrd3Q91W18 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tdrd3Q91W18 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
Tdrd3Q91W18 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tdrd3Q91W18 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tdrd3Q91W18 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tdrd3Q91W18 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tdrd3Q91W18 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tdrd3Q91W18 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tdrd3Q91W18 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tdrd3Q91W18 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tdrd3Q91W18 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tdrd3Q91W18 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tdrd3Q91W18 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tdrd3Q91W18 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tdrd3Q91W18 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Tdrd3Q91W18 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tdrd3Q91W18 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tdrd3Q91W18 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tdrd3Q91W18 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tdrd3Q91W18 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Tdrd3Q91W18 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tdrd3Q91W18 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tdrd3Q91W18 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tdrd3Q91W18 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tdrd3Q91W18 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tdrd3Q91W18 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1788.9 ms