Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCF5

Tspan10, Tetraspanin-10, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan10Q8VCF5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tspan10Q8VCF5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tspan10Q8VCF5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tspan10Q8VCF5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Tspan10Q8VCF5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tspan10Q8VCF5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tspan10Q8VCF5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tspan10Q8VCF5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tspan10Q8VCF5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Tspan10Q8VCF5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tspan10Q8VCF5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tspan10Q8VCF5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tspan10Q8VCF5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tspan10Q8VCF5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tspan10Q8VCF5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tspan10Q8VCF5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tspan10Q8VCF5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tspan10Q8VCF5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tspan10Q8VCF5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tspan10Q8VCF5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tspan10Q8VCF5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tspan10Q8VCF5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tspan10Q8VCF5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tspan10Q8VCF5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tspan10Q8VCF5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tspan10Q8VCF5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tspan10Q8VCF5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tspan10Q8VCF5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tspan10Q8VCF5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tspan10Q8VCF5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tspan10Q8VCF5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tspan10Q8VCF5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tspan10Q8VCF5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tspan10Q8VCF5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tspan10Q8VCF5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tspan10Q8VCF5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tspan10Q8VCF5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tspan10Q8VCF5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tspan10Q8VCF5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tspan10Q8VCF5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tspan10Q8VCF5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tspan10Q8VCF5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tspan10Q8VCF5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tspan10Q8VCF5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tspan10Q8VCF5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tspan10Q8VCF5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tspan10Q8VCF5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tspan10Q8VCF5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tspan10Q8VCF5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tspan10Q8VCF5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tspan10Q8VCF5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tspan10Q8VCF5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tspan10Q8VCF5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tspan10Q8VCF5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tspan10Q8VCF5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tspan10Q8VCF5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tspan10Q8VCF5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tspan10Q8VCF5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tspan10Q8VCF5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tspan10Q8VCF5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tspan10Q8VCF5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tspan10Q8VCF5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tspan10Q8VCF5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tspan10Q8VCF5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Tspan10Q8VCF5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tspan10Q8VCF5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tspan10Q8VCF5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tspan10Q8VCF5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tspan10Q8VCF5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tspan10Q8VCF5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tspan10Q8VCF5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tspan10Q8VCF5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tspan10Q8VCF5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tspan10Q8VCF5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tspan10Q8VCF5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tspan10Q8VCF5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tspan10Q8VCF5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tspan10Q8VCF5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tspan10Q8VCF5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tspan10Q8VCF5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tspan10Q8VCF5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tspan10Q8VCF5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tspan10Q8VCF5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tspan10Q8VCF5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Tspan10Q8VCF5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Tspan10Q8VCF5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tspan10Q8VCF5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tspan10Q8VCF5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tspan10Q8VCF5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tspan10Q8VCF5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tspan10Q8VCF5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tspan10Q8VCF5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tspan10Q8VCF5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tspan10Q8VCF5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tspan10Q8VCF5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tspan10Q8VCF5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tspan10Q8VCF5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tspan10Q8VCF5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tspan10Q8VCF5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tspan10Q8VCF5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms