Protein–RNA interactions for Protein: Q8R422

Cd109, CD109 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd109Q8R422 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.43
Cd109Q8R422 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Cd109Q8R422 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Cd109Q8R422 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Cd109Q8R422 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Cd109Q8R422 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Cd109Q8R422 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Cd109Q8R422 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Cd109Q8R422 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Cd109Q8R422 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Cd109Q8R422 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
Cd109Q8R422 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Cd109Q8R422 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Cd109Q8R422 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Cd109Q8R422 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Cd109Q8R422 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Cd109Q8R422 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
Cd109Q8R422 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
Cd109Q8R422 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Cd109Q8R422 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Cd109Q8R422 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
Cd109Q8R422 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Cd109Q8R422 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Cd109Q8R422 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Cd109Q8R422 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Cd109Q8R422 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Cd109Q8R422 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Cd109Q8R422 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Cd109Q8R422 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Cd109Q8R422 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Cd109Q8R422 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Cd109Q8R422 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Cd109Q8R422 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Cd109Q8R422 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Cd109Q8R422 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Cd109Q8R422 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Cd109Q8R422 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Cd109Q8R422 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Cd109Q8R422 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Cd109Q8R422 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Cd109Q8R422 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Cd109Q8R422 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Cd109Q8R422 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Cd109Q8R422 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Cd109Q8R422 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Cd109Q8R422 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Cd109Q8R422 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Cd109Q8R422 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Cd109Q8R422 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
Cd109Q8R422 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Cd109Q8R422 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Cd109Q8R422 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
Cd109Q8R422 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Cd109Q8R422 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Cd109Q8R422 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Cd109Q8R422 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Cd109Q8R422 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Cd109Q8R422 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Cd109Q8R422 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Cd109Q8R422 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Cd109Q8R422 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Cd109Q8R422 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Cd109Q8R422 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Cd109Q8R422 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Cd109Q8R422 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Cd109Q8R422 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Cd109Q8R422 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Cd109Q8R422 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Cd109Q8R422 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
Cd109Q8R422 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC36■■■■□ 3.35
Cd109Q8R422 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Cd109Q8R422 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Cd109Q8R422 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Cd109Q8R422 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.34
Cd109Q8R422 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
Cd109Q8R422 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Cd109Q8R422 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Cd109Q8R422 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Cd109Q8R422 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Cd109Q8R422 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Cd109Q8R422 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
Cd109Q8R422 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Cd109Q8R422 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Cd109Q8R422 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Cd109Q8R422 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Cd109Q8R422 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Cd109Q8R422 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Cd109Q8R422 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Cd109Q8R422 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Cd109Q8R422 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Cd109Q8R422 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Cd109Q8R422 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
Cd109Q8R422 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Cd109Q8R422 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Cd109Q8R422 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Cd109Q8R422 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Cd109Q8R422 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Cd109Q8R422 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Cd109Q8R422 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Cd109Q8R422 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms