Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
OptnQ8K3K8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
OptnQ8K3K8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
OptnQ8K3K8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
OptnQ8K3K8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
OptnQ8K3K8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
OptnQ8K3K8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
OptnQ8K3K8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
OptnQ8K3K8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
OptnQ8K3K8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
OptnQ8K3K8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC33.2■■■□□ 2.9
OptnQ8K3K8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
OptnQ8K3K8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
OptnQ8K3K8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
OptnQ8K3K8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
OptnQ8K3K8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
OptnQ8K3K8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
OptnQ8K3K8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
OptnQ8K3K8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
OptnQ8K3K8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
OptnQ8K3K8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
OptnQ8K3K8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
OptnQ8K3K8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
OptnQ8K3K8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
OptnQ8K3K8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
OptnQ8K3K8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
OptnQ8K3K8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
OptnQ8K3K8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
OptnQ8K3K8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
OptnQ8K3K8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
OptnQ8K3K8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
OptnQ8K3K8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
OptnQ8K3K8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
OptnQ8K3K8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
OptnQ8K3K8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
OptnQ8K3K8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
OptnQ8K3K8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
OptnQ8K3K8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
OptnQ8K3K8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
OptnQ8K3K8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
OptnQ8K3K8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
OptnQ8K3K8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
OptnQ8K3K8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
OptnQ8K3K8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
OptnQ8K3K8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
OptnQ8K3K8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
OptnQ8K3K8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
OptnQ8K3K8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
OptnQ8K3K8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
OptnQ8K3K8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
OptnQ8K3K8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
OptnQ8K3K8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
OptnQ8K3K8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
OptnQ8K3K8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
OptnQ8K3K8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
OptnQ8K3K8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
OptnQ8K3K8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
OptnQ8K3K8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
OptnQ8K3K8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
OptnQ8K3K8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
OptnQ8K3K8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
OptnQ8K3K8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
OptnQ8K3K8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
OptnQ8K3K8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
OptnQ8K3K8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
OptnQ8K3K8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC32.78■■■□□ 2.84
OptnQ8K3K8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
OptnQ8K3K8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
OptnQ8K3K8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
OptnQ8K3K8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
OptnQ8K3K8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
OptnQ8K3K8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
OptnQ8K3K8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC32.74■■■□□ 2.83
OptnQ8K3K8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
OptnQ8K3K8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
OptnQ8K3K8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
OptnQ8K3K8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
OptnQ8K3K8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
OptnQ8K3K8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC32.7■■■□□ 2.83
OptnQ8K3K8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
OptnQ8K3K8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
OptnQ8K3K8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
OptnQ8K3K8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
OptnQ8K3K8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
OptnQ8K3K8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
OptnQ8K3K8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
OptnQ8K3K8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
OptnQ8K3K8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
OptnQ8K3K8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
OptnQ8K3K8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
OptnQ8K3K8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
OptnQ8K3K8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
OptnQ8K3K8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
OptnQ8K3K8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
OptnQ8K3K8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
OptnQ8K3K8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
OptnQ8K3K8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
OptnQ8K3K8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
OptnQ8K3K8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
OptnQ8K3K8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms