Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1T1

Lrrc25, Leucine-rich repeat-containing protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc25Q8K1T1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrrc25Q8K1T1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrrc25Q8K1T1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrrc25Q8K1T1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrrc25Q8K1T1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrc25Q8K1T1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrc25Q8K1T1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrc25Q8K1T1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrrc25Q8K1T1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrrc25Q8K1T1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrrc25Q8K1T1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrrc25Q8K1T1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrc25Q8K1T1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrc25Q8K1T1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc25Q8K1T1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc25Q8K1T1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc25Q8K1T1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrc25Q8K1T1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrc25Q8K1T1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrc25Q8K1T1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrc25Q8K1T1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrc25Q8K1T1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrc25Q8K1T1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Lrrc25Q8K1T1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrrc25Q8K1T1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrc25Q8K1T1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc25Q8K1T1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc25Q8K1T1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc25Q8K1T1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrc25Q8K1T1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrc25Q8K1T1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc25Q8K1T1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc25Q8K1T1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrc25Q8K1T1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrc25Q8K1T1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrc25Q8K1T1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc25Q8K1T1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc25Q8K1T1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc25Q8K1T1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc25Q8K1T1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrc25Q8K1T1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrc25Q8K1T1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrc25Q8K1T1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrc25Q8K1T1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrc25Q8K1T1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrc25Q8K1T1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrrc25Q8K1T1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrrc25Q8K1T1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrrc25Q8K1T1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrrc25Q8K1T1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrrc25Q8K1T1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrrc25Q8K1T1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrrc25Q8K1T1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrrc25Q8K1T1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrrc25Q8K1T1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrrc25Q8K1T1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrrc25Q8K1T1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrrc25Q8K1T1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Lrrc25Q8K1T1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lrrc25Q8K1T1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lrrc25Q8K1T1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrrc25Q8K1T1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrrc25Q8K1T1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrrc25Q8K1T1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrrc25Q8K1T1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrrc25Q8K1T1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrrc25Q8K1T1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrrc25Q8K1T1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrrc25Q8K1T1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrrc25Q8K1T1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrrc25Q8K1T1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrrc25Q8K1T1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrrc25Q8K1T1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrrc25Q8K1T1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrrc25Q8K1T1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrrc25Q8K1T1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lrrc25Q8K1T1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrrc25Q8K1T1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrrc25Q8K1T1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrrc25Q8K1T1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrrc25Q8K1T1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrrc25Q8K1T1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrrc25Q8K1T1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrrc25Q8K1T1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrrc25Q8K1T1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrrc25Q8K1T1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrrc25Q8K1T1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrrc25Q8K1T1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrrc25Q8K1T1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrrc25Q8K1T1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrrc25Q8K1T1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrrc25Q8K1T1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrc25Q8K1T1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrc25Q8K1T1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrc25Q8K1T1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrc25Q8K1T1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrrc25Q8K1T1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrc25Q8K1T1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrc25Q8K1T1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrc25Q8K1T1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms