Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0U3

Tmem17, Transmembrane protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem17Q8K0U3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmem17Q8K0U3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmem17Q8K0U3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmem17Q8K0U3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmem17Q8K0U3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmem17Q8K0U3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmem17Q8K0U3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmem17Q8K0U3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmem17Q8K0U3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmem17Q8K0U3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmem17Q8K0U3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmem17Q8K0U3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem17Q8K0U3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem17Q8K0U3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem17Q8K0U3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem17Q8K0U3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem17Q8K0U3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem17Q8K0U3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem17Q8K0U3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem17Q8K0U3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem17Q8K0U3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem17Q8K0U3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem17Q8K0U3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem17Q8K0U3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem17Q8K0U3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem17Q8K0U3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem17Q8K0U3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem17Q8K0U3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tmem17Q8K0U3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem17Q8K0U3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem17Q8K0U3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem17Q8K0U3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem17Q8K0U3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem17Q8K0U3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem17Q8K0U3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem17Q8K0U3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem17Q8K0U3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem17Q8K0U3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem17Q8K0U3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem17Q8K0U3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem17Q8K0U3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem17Q8K0U3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmem17Q8K0U3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmem17Q8K0U3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Tmem17Q8K0U3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tmem17Q8K0U3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem17Q8K0U3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tmem17Q8K0U3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem17Q8K0U3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tmem17Q8K0U3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem17Q8K0U3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem17Q8K0U3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem17Q8K0U3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem17Q8K0U3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem17Q8K0U3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem17Q8K0U3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem17Q8K0U3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem17Q8K0U3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem17Q8K0U3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem17Q8K0U3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem17Q8K0U3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem17Q8K0U3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem17Q8K0U3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem17Q8K0U3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem17Q8K0U3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem17Q8K0U3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem17Q8K0U3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem17Q8K0U3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem17Q8K0U3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem17Q8K0U3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem17Q8K0U3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem17Q8K0U3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem17Q8K0U3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem17Q8K0U3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmem17Q8K0U3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmem17Q8K0U3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmem17Q8K0U3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmem17Q8K0U3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmem17Q8K0U3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmem17Q8K0U3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmem17Q8K0U3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmem17Q8K0U3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmem17Q8K0U3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmem17Q8K0U3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmem17Q8K0U3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmem17Q8K0U3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmem17Q8K0U3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmem17Q8K0U3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmem17Q8K0U3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmem17Q8K0U3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmem17Q8K0U3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmem17Q8K0U3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmem17Q8K0U3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmem17Q8K0U3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmem17Q8K0U3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmem17Q8K0U3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmem17Q8K0U3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmem17Q8K0U3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmem17Q8K0U3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmem17Q8K0U3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms