Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pkn3Q8K045 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pkn3Q8K045 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pkn3Q8K045 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pkn3Q8K045 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pkn3Q8K045 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pkn3Q8K045 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pkn3Q8K045 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Pkn3Q8K045 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pkn3Q8K045 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pkn3Q8K045 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pkn3Q8K045 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pkn3Q8K045 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pkn3Q8K045 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pkn3Q8K045 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pkn3Q8K045 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pkn3Q8K045 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pkn3Q8K045 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pkn3Q8K045 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pkn3Q8K045 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pkn3Q8K045 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pkn3Q8K045 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pkn3Q8K045 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pkn3Q8K045 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pkn3Q8K045 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Pkn3Q8K045 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pkn3Q8K045 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pkn3Q8K045 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pkn3Q8K045 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pkn3Q8K045 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pkn3Q8K045 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pkn3Q8K045 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pkn3Q8K045 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pkn3Q8K045 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pkn3Q8K045 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pkn3Q8K045 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pkn3Q8K045 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pkn3Q8K045 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pkn3Q8K045 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pkn3Q8K045 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pkn3Q8K045 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pkn3Q8K045 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Pkn3Q8K045 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pkn3Q8K045 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Pkn3Q8K045 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pkn3Q8K045 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pkn3Q8K045 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pkn3Q8K045 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pkn3Q8K045 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pkn3Q8K045 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pkn3Q8K045 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pkn3Q8K045 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pkn3Q8K045 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pkn3Q8K045 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pkn3Q8K045 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pkn3Q8K045 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pkn3Q8K045 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pkn3Q8K045 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pkn3Q8K045 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pkn3Q8K045 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Pkn3Q8K045 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Pkn3Q8K045 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pkn3Q8K045 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pkn3Q8K045 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pkn3Q8K045 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pkn3Q8K045 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pkn3Q8K045 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pkn3Q8K045 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pkn3Q8K045 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pkn3Q8K045 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pkn3Q8K045 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pkn3Q8K045 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pkn3Q8K045 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pkn3Q8K045 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pkn3Q8K045 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pkn3Q8K045 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pkn3Q8K045 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pkn3Q8K045 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pkn3Q8K045 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pkn3Q8K045 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Pkn3Q8K045 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pkn3Q8K045 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pkn3Q8K045 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pkn3Q8K045 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pkn3Q8K045 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pkn3Q8K045 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pkn3Q8K045 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pkn3Q8K045 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pkn3Q8K045 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pkn3Q8K045 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pkn3Q8K045 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Pkn3Q8K045 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pkn3Q8K045 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pkn3Q8K045 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pkn3Q8K045 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pkn3Q8K045 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pkn3Q8K045 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pkn3Q8K045 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pkn3Q8K045 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pkn3Q8K045 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.6 ms