Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZR6

Slc4a8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a8Q8JZR6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Slc4a8Q8JZR6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Slc4a8Q8JZR6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Slc4a8Q8JZR6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Slc4a8Q8JZR6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Slc4a8Q8JZR6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Slc4a8Q8JZR6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Slc4a8Q8JZR6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Slc4a8Q8JZR6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Slc4a8Q8JZR6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Slc4a8Q8JZR6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Slc4a8Q8JZR6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Slc4a8Q8JZR6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Slc4a8Q8JZR6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Slc4a8Q8JZR6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Slc4a8Q8JZR6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Slc4a8Q8JZR6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Slc4a8Q8JZR6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Slc4a8Q8JZR6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Slc4a8Q8JZR6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Slc4a8Q8JZR6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Slc4a8Q8JZR6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Slc4a8Q8JZR6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Slc4a8Q8JZR6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Slc4a8Q8JZR6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Slc4a8Q8JZR6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
Slc4a8Q8JZR6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Slc4a8Q8JZR6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Slc4a8Q8JZR6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Slc4a8Q8JZR6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Slc4a8Q8JZR6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Slc4a8Q8JZR6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Slc4a8Q8JZR6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Slc4a8Q8JZR6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Slc4a8Q8JZR6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Slc4a8Q8JZR6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Slc4a8Q8JZR6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Slc4a8Q8JZR6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Slc4a8Q8JZR6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Slc4a8Q8JZR6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Slc4a8Q8JZR6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Slc4a8Q8JZR6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Slc4a8Q8JZR6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Slc4a8Q8JZR6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Slc4a8Q8JZR6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Slc4a8Q8JZR6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Slc4a8Q8JZR6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Slc4a8Q8JZR6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Slc4a8Q8JZR6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Slc4a8Q8JZR6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Slc4a8Q8JZR6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Slc4a8Q8JZR6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Slc4a8Q8JZR6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Slc4a8Q8JZR6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Slc4a8Q8JZR6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Slc4a8Q8JZR6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Slc4a8Q8JZR6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Slc4a8Q8JZR6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Slc4a8Q8JZR6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Slc4a8Q8JZR6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Slc4a8Q8JZR6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Slc4a8Q8JZR6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Slc4a8Q8JZR6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Slc4a8Q8JZR6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Slc4a8Q8JZR6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Slc4a8Q8JZR6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Slc4a8Q8JZR6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Slc4a8Q8JZR6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Slc4a8Q8JZR6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Slc4a8Q8JZR6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Slc4a8Q8JZR6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Slc4a8Q8JZR6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Slc4a8Q8JZR6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Slc4a8Q8JZR6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Slc4a8Q8JZR6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Slc4a8Q8JZR6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Slc4a8Q8JZR6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Slc4a8Q8JZR6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Slc4a8Q8JZR6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Slc4a8Q8JZR6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Slc4a8Q8JZR6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Slc4a8Q8JZR6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Slc4a8Q8JZR6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Slc4a8Q8JZR6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Slc4a8Q8JZR6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Slc4a8Q8JZR6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Slc4a8Q8JZR6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Slc4a8Q8JZR6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Slc4a8Q8JZR6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Slc4a8Q8JZR6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Slc4a8Q8JZR6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Slc4a8Q8JZR6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Slc4a8Q8JZR6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Slc4a8Q8JZR6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Slc4a8Q8JZR6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Slc4a8Q8JZR6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Slc4a8Q8JZR6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Slc4a8Q8JZR6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Slc4a8Q8JZR6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Slc4a8Q8JZR6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms