Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LgsnQ8CIX8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
LgsnQ8CIX8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LgsnQ8CIX8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LgsnQ8CIX8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LgsnQ8CIX8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LgsnQ8CIX8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LgsnQ8CIX8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
LgsnQ8CIX8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LgsnQ8CIX8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LgsnQ8CIX8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LgsnQ8CIX8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
LgsnQ8CIX8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LgsnQ8CIX8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LgsnQ8CIX8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LgsnQ8CIX8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LgsnQ8CIX8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LgsnQ8CIX8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LgsnQ8CIX8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LgsnQ8CIX8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
LgsnQ8CIX8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LgsnQ8CIX8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LgsnQ8CIX8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LgsnQ8CIX8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LgsnQ8CIX8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LgsnQ8CIX8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LgsnQ8CIX8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LgsnQ8CIX8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LgsnQ8CIX8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LgsnQ8CIX8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LgsnQ8CIX8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LgsnQ8CIX8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LgsnQ8CIX8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LgsnQ8CIX8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LgsnQ8CIX8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LgsnQ8CIX8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LgsnQ8CIX8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LgsnQ8CIX8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LgsnQ8CIX8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LgsnQ8CIX8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LgsnQ8CIX8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
LgsnQ8CIX8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LgsnQ8CIX8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LgsnQ8CIX8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LgsnQ8CIX8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LgsnQ8CIX8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LgsnQ8CIX8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LgsnQ8CIX8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LgsnQ8CIX8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LgsnQ8CIX8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
LgsnQ8CIX8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LgsnQ8CIX8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LgsnQ8CIX8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LgsnQ8CIX8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LgsnQ8CIX8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LgsnQ8CIX8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LgsnQ8CIX8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LgsnQ8CIX8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LgsnQ8CIX8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LgsnQ8CIX8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LgsnQ8CIX8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LgsnQ8CIX8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LgsnQ8CIX8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LgsnQ8CIX8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LgsnQ8CIX8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LgsnQ8CIX8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LgsnQ8CIX8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LgsnQ8CIX8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LgsnQ8CIX8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
LgsnQ8CIX8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LgsnQ8CIX8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LgsnQ8CIX8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LgsnQ8CIX8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LgsnQ8CIX8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LgsnQ8CIX8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LgsnQ8CIX8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LgsnQ8CIX8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LgsnQ8CIX8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LgsnQ8CIX8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LgsnQ8CIX8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LgsnQ8CIX8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LgsnQ8CIX8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LgsnQ8CIX8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LgsnQ8CIX8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LgsnQ8CIX8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
LgsnQ8CIX8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LgsnQ8CIX8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LgsnQ8CIX8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
LgsnQ8CIX8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LgsnQ8CIX8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LgsnQ8CIX8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LgsnQ8CIX8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LgsnQ8CIX8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LgsnQ8CIX8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LgsnQ8CIX8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LgsnQ8CIX8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LgsnQ8CIX8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LgsnQ8CIX8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
LgsnQ8CIX8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LgsnQ8CIX8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms