Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC4

Lsm14b, Protein LSM14 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm14bQ8CGC4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lsm14bQ8CGC4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lsm14bQ8CGC4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lsm14bQ8CGC4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lsm14bQ8CGC4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lsm14bQ8CGC4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lsm14bQ8CGC4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lsm14bQ8CGC4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lsm14bQ8CGC4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lsm14bQ8CGC4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Lsm14bQ8CGC4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Lsm14bQ8CGC4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lsm14bQ8CGC4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lsm14bQ8CGC4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lsm14bQ8CGC4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lsm14bQ8CGC4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lsm14bQ8CGC4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lsm14bQ8CGC4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lsm14bQ8CGC4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lsm14bQ8CGC4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lsm14bQ8CGC4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lsm14bQ8CGC4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lsm14bQ8CGC4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lsm14bQ8CGC4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lsm14bQ8CGC4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lsm14bQ8CGC4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lsm14bQ8CGC4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Lsm14bQ8CGC4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lsm14bQ8CGC4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lsm14bQ8CGC4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lsm14bQ8CGC4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lsm14bQ8CGC4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lsm14bQ8CGC4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lsm14bQ8CGC4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lsm14bQ8CGC4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lsm14bQ8CGC4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Lsm14bQ8CGC4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lsm14bQ8CGC4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lsm14bQ8CGC4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Lsm14bQ8CGC4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lsm14bQ8CGC4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lsm14bQ8CGC4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lsm14bQ8CGC4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lsm14bQ8CGC4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lsm14bQ8CGC4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lsm14bQ8CGC4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lsm14bQ8CGC4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lsm14bQ8CGC4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Lsm14bQ8CGC4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lsm14bQ8CGC4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lsm14bQ8CGC4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lsm14bQ8CGC4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lsm14bQ8CGC4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lsm14bQ8CGC4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Lsm14bQ8CGC4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Lsm14bQ8CGC4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lsm14bQ8CGC4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lsm14bQ8CGC4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lsm14bQ8CGC4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lsm14bQ8CGC4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lsm14bQ8CGC4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lsm14bQ8CGC4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lsm14bQ8CGC4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lsm14bQ8CGC4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lsm14bQ8CGC4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lsm14bQ8CGC4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lsm14bQ8CGC4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lsm14bQ8CGC4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lsm14bQ8CGC4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lsm14bQ8CGC4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lsm14bQ8CGC4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lsm14bQ8CGC4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lsm14bQ8CGC4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lsm14bQ8CGC4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lsm14bQ8CGC4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lsm14bQ8CGC4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lsm14bQ8CGC4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lsm14bQ8CGC4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lsm14bQ8CGC4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lsm14bQ8CGC4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lsm14bQ8CGC4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lsm14bQ8CGC4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lsm14bQ8CGC4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lsm14bQ8CGC4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lsm14bQ8CGC4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lsm14bQ8CGC4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lsm14bQ8CGC4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lsm14bQ8CGC4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lsm14bQ8CGC4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lsm14bQ8CGC4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lsm14bQ8CGC4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lsm14bQ8CGC4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lsm14bQ8CGC4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lsm14bQ8CGC4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Lsm14bQ8CGC4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lsm14bQ8CGC4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lsm14bQ8CGC4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lsm14bQ8CGC4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lsm14bQ8CGC4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Lsm14bQ8CGC4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
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