Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFZ5

Slc22a12, Solute carrier family 22 member 12, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a12Q8CFZ5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc22a12Q8CFZ5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc22a12Q8CFZ5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc22a12Q8CFZ5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc22a12Q8CFZ5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc22a12Q8CFZ5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc22a12Q8CFZ5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc22a12Q8CFZ5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc22a12Q8CFZ5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc22a12Q8CFZ5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc22a12Q8CFZ5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc22a12Q8CFZ5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc22a12Q8CFZ5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc22a12Q8CFZ5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc22a12Q8CFZ5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc22a12Q8CFZ5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc22a12Q8CFZ5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc22a12Q8CFZ5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc22a12Q8CFZ5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc22a12Q8CFZ5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc22a12Q8CFZ5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc22a12Q8CFZ5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc22a12Q8CFZ5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc22a12Q8CFZ5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc22a12Q8CFZ5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc22a12Q8CFZ5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc22a12Q8CFZ5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc22a12Q8CFZ5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc22a12Q8CFZ5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc22a12Q8CFZ5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc22a12Q8CFZ5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc22a12Q8CFZ5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc22a12Q8CFZ5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc22a12Q8CFZ5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc22a12Q8CFZ5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc22a12Q8CFZ5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc22a12Q8CFZ5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc22a12Q8CFZ5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc22a12Q8CFZ5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc22a12Q8CFZ5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc22a12Q8CFZ5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc22a12Q8CFZ5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc22a12Q8CFZ5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc22a12Q8CFZ5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc22a12Q8CFZ5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc22a12Q8CFZ5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc22a12Q8CFZ5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc22a12Q8CFZ5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc22a12Q8CFZ5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc22a12Q8CFZ5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc22a12Q8CFZ5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc22a12Q8CFZ5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc22a12Q8CFZ5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc22a12Q8CFZ5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc22a12Q8CFZ5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc22a12Q8CFZ5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc22a12Q8CFZ5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Slc22a12Q8CFZ5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc22a12Q8CFZ5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc22a12Q8CFZ5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc22a12Q8CFZ5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc22a12Q8CFZ5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc22a12Q8CFZ5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc22a12Q8CFZ5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc22a12Q8CFZ5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc22a12Q8CFZ5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc22a12Q8CFZ5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc22a12Q8CFZ5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc22a12Q8CFZ5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc22a12Q8CFZ5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc22a12Q8CFZ5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc22a12Q8CFZ5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc22a12Q8CFZ5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc22a12Q8CFZ5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc22a12Q8CFZ5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc22a12Q8CFZ5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc22a12Q8CFZ5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc22a12Q8CFZ5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc22a12Q8CFZ5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc22a12Q8CFZ5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc22a12Q8CFZ5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc22a12Q8CFZ5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc22a12Q8CFZ5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc22a12Q8CFZ5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc22a12Q8CFZ5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc22a12Q8CFZ5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc22a12Q8CFZ5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc22a12Q8CFZ5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc22a12Q8CFZ5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc22a12Q8CFZ5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc22a12Q8CFZ5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc22a12Q8CFZ5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc22a12Q8CFZ5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc22a12Q8CFZ5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc22a12Q8CFZ5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc22a12Q8CFZ5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc22a12Q8CFZ5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc22a12Q8CFZ5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc22a12Q8CFZ5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc22a12Q8CFZ5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms