Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc17Q8CE13 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc17Q8CE13 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc17Q8CE13 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc17Q8CE13 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc17Q8CE13 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc17Q8CE13 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc17Q8CE13 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc17Q8CE13 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc17Q8CE13 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc17Q8CE13 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc17Q8CE13 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc17Q8CE13 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc17Q8CE13 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc17Q8CE13 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc17Q8CE13 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc17Q8CE13 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc17Q8CE13 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc17Q8CE13 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc17Q8CE13 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc17Q8CE13 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc17Q8CE13 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc17Q8CE13 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc17Q8CE13 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc17Q8CE13 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc17Q8CE13 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc17Q8CE13 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc17Q8CE13 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc17Q8CE13 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc17Q8CE13 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc17Q8CE13 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc17Q8CE13 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc17Q8CE13 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc17Q8CE13 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc17Q8CE13 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccdc17Q8CE13 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc17Q8CE13 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc17Q8CE13 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc17Q8CE13 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc17Q8CE13 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc17Q8CE13 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc17Q8CE13 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc17Q8CE13 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc17Q8CE13 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc17Q8CE13 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc17Q8CE13 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc17Q8CE13 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc17Q8CE13 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc17Q8CE13 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc17Q8CE13 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc17Q8CE13 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc17Q8CE13 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc17Q8CE13 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc17Q8CE13 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc17Q8CE13 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc17Q8CE13 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc17Q8CE13 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc17Q8CE13 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc17Q8CE13 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc17Q8CE13 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc17Q8CE13 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc17Q8CE13 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc17Q8CE13 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc17Q8CE13 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc17Q8CE13 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc17Q8CE13 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc17Q8CE13 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc17Q8CE13 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc17Q8CE13 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc17Q8CE13 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc17Q8CE13 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc17Q8CE13 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc17Q8CE13 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc17Q8CE13 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc17Q8CE13 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc17Q8CE13 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc17Q8CE13 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc17Q8CE13 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc17Q8CE13 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc17Q8CE13 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc17Q8CE13 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc17Q8CE13 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc17Q8CE13 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc17Q8CE13 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc17Q8CE13 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc17Q8CE13 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc17Q8CE13 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc17Q8CE13 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc17Q8CE13 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc17Q8CE13 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc17Q8CE13 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc17Q8CE13 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc17Q8CE13 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc17Q8CE13 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc17Q8CE13 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc17Q8CE13 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc17Q8CE13 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc17Q8CE13 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc17Q8CE13 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc17Q8CE13 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms