Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD94

Lin52, Protein lin-52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin52Q8CD94 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lin52Q8CD94 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lin52Q8CD94 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lin52Q8CD94 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lin52Q8CD94 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lin52Q8CD94 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lin52Q8CD94 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lin52Q8CD94 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lin52Q8CD94 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lin52Q8CD94 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lin52Q8CD94 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lin52Q8CD94 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lin52Q8CD94 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lin52Q8CD94 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lin52Q8CD94 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lin52Q8CD94 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lin52Q8CD94 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lin52Q8CD94 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lin52Q8CD94 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lin52Q8CD94 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lin52Q8CD94 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lin52Q8CD94 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lin52Q8CD94 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lin52Q8CD94 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lin52Q8CD94 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lin52Q8CD94 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lin52Q8CD94 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lin52Q8CD94 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lin52Q8CD94 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lin52Q8CD94 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lin52Q8CD94 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lin52Q8CD94 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lin52Q8CD94 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lin52Q8CD94 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lin52Q8CD94 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Lin52Q8CD94 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lin52Q8CD94 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lin52Q8CD94 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lin52Q8CD94 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lin52Q8CD94 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lin52Q8CD94 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lin52Q8CD94 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lin52Q8CD94 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lin52Q8CD94 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lin52Q8CD94 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lin52Q8CD94 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lin52Q8CD94 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lin52Q8CD94 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lin52Q8CD94 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lin52Q8CD94 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lin52Q8CD94 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lin52Q8CD94 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lin52Q8CD94 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lin52Q8CD94 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lin52Q8CD94 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lin52Q8CD94 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lin52Q8CD94 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lin52Q8CD94 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lin52Q8CD94 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lin52Q8CD94 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lin52Q8CD94 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lin52Q8CD94 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lin52Q8CD94 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lin52Q8CD94 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lin52Q8CD94 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lin52Q8CD94 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lin52Q8CD94 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lin52Q8CD94 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lin52Q8CD94 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lin52Q8CD94 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lin52Q8CD94 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lin52Q8CD94 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lin52Q8CD94 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lin52Q8CD94 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lin52Q8CD94 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lin52Q8CD94 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lin52Q8CD94 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lin52Q8CD94 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lin52Q8CD94 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lin52Q8CD94 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Lin52Q8CD94 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lin52Q8CD94 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lin52Q8CD94 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lin52Q8CD94 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lin52Q8CD94 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lin52Q8CD94 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lin52Q8CD94 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Lin52Q8CD94 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lin52Q8CD94 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lin52Q8CD94 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lin52Q8CD94 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lin52Q8CD94 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lin52Q8CD94 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lin52Q8CD94 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Lin52Q8CD94 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lin52Q8CD94 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Lin52Q8CD94 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lin52Q8CD94 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lin52Q8CD94 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lin52Q8CD94 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms