Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9J3

Spef2, Sperm flagellar protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef2Q8C9J3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Spef2Q8C9J3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Spef2Q8C9J3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Spef2Q8C9J3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Spef2Q8C9J3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Spef2Q8C9J3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Spef2Q8C9J3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Spef2Q8C9J3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Spef2Q8C9J3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Spef2Q8C9J3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Spef2Q8C9J3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Spef2Q8C9J3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Spef2Q8C9J3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Spef2Q8C9J3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Spef2Q8C9J3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
Spef2Q8C9J3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Spef2Q8C9J3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Spef2Q8C9J3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Spef2Q8C9J3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Spef2Q8C9J3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Spef2Q8C9J3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Spef2Q8C9J3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Spef2Q8C9J3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Spef2Q8C9J3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Spef2Q8C9J3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Spef2Q8C9J3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
Spef2Q8C9J3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Spef2Q8C9J3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
Spef2Q8C9J3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Spef2Q8C9J3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Spef2Q8C9J3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Spef2Q8C9J3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Spef2Q8C9J3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Spef2Q8C9J3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Spef2Q8C9J3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Spef2Q8C9J3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Spef2Q8C9J3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Spef2Q8C9J3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Spef2Q8C9J3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Spef2Q8C9J3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
Spef2Q8C9J3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Spef2Q8C9J3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Spef2Q8C9J3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Spef2Q8C9J3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Spef2Q8C9J3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Spef2Q8C9J3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Spef2Q8C9J3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Spef2Q8C9J3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Spef2Q8C9J3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Spef2Q8C9J3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
Spef2Q8C9J3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
Spef2Q8C9J3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
Spef2Q8C9J3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Spef2Q8C9J3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Spef2Q8C9J3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Spef2Q8C9J3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Spef2Q8C9J3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Spef2Q8C9J3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Spef2Q8C9J3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Spef2Q8C9J3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Spef2Q8C9J3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Spef2Q8C9J3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Spef2Q8C9J3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Spef2Q8C9J3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Spef2Q8C9J3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Spef2Q8C9J3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Spef2Q8C9J3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Spef2Q8C9J3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Spef2Q8C9J3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Spef2Q8C9J3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Spef2Q8C9J3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Spef2Q8C9J3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Spef2Q8C9J3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
Spef2Q8C9J3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Spef2Q8C9J3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Spef2Q8C9J3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
Spef2Q8C9J3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Spef2Q8C9J3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Spef2Q8C9J3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Spef2Q8C9J3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Spef2Q8C9J3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
Spef2Q8C9J3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Spef2Q8C9J3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Spef2Q8C9J3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Spef2Q8C9J3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Spef2Q8C9J3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Spef2Q8C9J3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Spef2Q8C9J3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.77
Spef2Q8C9J3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Spef2Q8C9J3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Spef2Q8C9J3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Spef2Q8C9J3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Spef2Q8C9J3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Spef2Q8C9J3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Spef2Q8C9J3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Spef2Q8C9J3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Spef2Q8C9J3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Spef2Q8C9J3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Spef2Q8C9J3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Spef2Q8C9J3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms