Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Usp20Q8C6M1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Usp20Q8C6M1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Usp20Q8C6M1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Usp20Q8C6M1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Usp20Q8C6M1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Usp20Q8C6M1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Usp20Q8C6M1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Usp20Q8C6M1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Usp20Q8C6M1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Usp20Q8C6M1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Usp20Q8C6M1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Usp20Q8C6M1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Usp20Q8C6M1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Usp20Q8C6M1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Usp20Q8C6M1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Usp20Q8C6M1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Usp20Q8C6M1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Usp20Q8C6M1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Usp20Q8C6M1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Usp20Q8C6M1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Usp20Q8C6M1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Usp20Q8C6M1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Usp20Q8C6M1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Usp20Q8C6M1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Usp20Q8C6M1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Usp20Q8C6M1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Usp20Q8C6M1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Usp20Q8C6M1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Usp20Q8C6M1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Usp20Q8C6M1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Usp20Q8C6M1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Usp20Q8C6M1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Usp20Q8C6M1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Usp20Q8C6M1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Usp20Q8C6M1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Usp20Q8C6M1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Usp20Q8C6M1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Usp20Q8C6M1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Usp20Q8C6M1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Usp20Q8C6M1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Usp20Q8C6M1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Usp20Q8C6M1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Usp20Q8C6M1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Usp20Q8C6M1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Usp20Q8C6M1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Usp20Q8C6M1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Usp20Q8C6M1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Usp20Q8C6M1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Usp20Q8C6M1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Usp20Q8C6M1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Usp20Q8C6M1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Usp20Q8C6M1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Usp20Q8C6M1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Usp20Q8C6M1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Usp20Q8C6M1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Usp20Q8C6M1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Usp20Q8C6M1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Usp20Q8C6M1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Usp20Q8C6M1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Usp20Q8C6M1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Usp20Q8C6M1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Usp20Q8C6M1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Usp20Q8C6M1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Usp20Q8C6M1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Usp20Q8C6M1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp20Q8C6M1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp20Q8C6M1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Usp20Q8C6M1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Usp20Q8C6M1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Usp20Q8C6M1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Usp20Q8C6M1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Usp20Q8C6M1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Usp20Q8C6M1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Usp20Q8C6M1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp20Q8C6M1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp20Q8C6M1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Usp20Q8C6M1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Usp20Q8C6M1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Usp20Q8C6M1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Usp20Q8C6M1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Usp20Q8C6M1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Usp20Q8C6M1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Usp20Q8C6M1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Usp20Q8C6M1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Usp20Q8C6M1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Usp20Q8C6M1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Usp20Q8C6M1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Usp20Q8C6M1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Usp20Q8C6M1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Usp20Q8C6M1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Usp20Q8C6M1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Usp20Q8C6M1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Usp20Q8C6M1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Usp20Q8C6M1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Usp20Q8C6M1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Usp20Q8C6M1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Usp20Q8C6M1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Usp20Q8C6M1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Usp20Q8C6M1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms