Protein–RNA interactions for Protein: Q8C084

Snx22, Sorting nexin 22, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx22Q8C084 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx22Q8C084 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx22Q8C084 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx22Q8C084 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snx22Q8C084 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snx22Q8C084 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx22Q8C084 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx22Q8C084 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx22Q8C084 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx22Q8C084 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx22Q8C084 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx22Q8C084 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx22Q8C084 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx22Q8C084 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx22Q8C084 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx22Q8C084 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx22Q8C084 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx22Q8C084 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx22Q8C084 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx22Q8C084 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx22Q8C084 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx22Q8C084 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx22Q8C084 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx22Q8C084 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx22Q8C084 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snx22Q8C084 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snx22Q8C084 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snx22Q8C084 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snx22Q8C084 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx22Q8C084 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx22Q8C084 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx22Q8C084 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx22Q8C084 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx22Q8C084 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx22Q8C084 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx22Q8C084 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx22Q8C084 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx22Q8C084 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx22Q8C084 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx22Q8C084 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx22Q8C084 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx22Q8C084 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx22Q8C084 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx22Q8C084 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx22Q8C084 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx22Q8C084 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx22Q8C084 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx22Q8C084 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx22Q8C084 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx22Q8C084 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx22Q8C084 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx22Q8C084 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx22Q8C084 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx22Q8C084 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx22Q8C084 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx22Q8C084 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx22Q8C084 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx22Q8C084 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx22Q8C084 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx22Q8C084 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx22Q8C084 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx22Q8C084 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx22Q8C084 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx22Q8C084 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx22Q8C084 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx22Q8C084 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx22Q8C084 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx22Q8C084 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx22Q8C084 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx22Q8C084 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx22Q8C084 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx22Q8C084 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx22Q8C084 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx22Q8C084 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx22Q8C084 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx22Q8C084 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx22Q8C084 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx22Q8C084 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx22Q8C084 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx22Q8C084 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx22Q8C084 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx22Q8C084 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx22Q8C084 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx22Q8C084 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx22Q8C084 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx22Q8C084 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx22Q8C084 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx22Q8C084 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx22Q8C084 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Snx22Q8C084 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx22Q8C084 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx22Q8C084 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx22Q8C084 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx22Q8C084 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx22Q8C084 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx22Q8C084 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx22Q8C084 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx22Q8C084 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx22Q8C084 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx22Q8C084 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms