Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim35Q8C006 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim35Q8C006 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim35Q8C006 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim35Q8C006 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim35Q8C006 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim35Q8C006 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim35Q8C006 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim35Q8C006 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim35Q8C006 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim35Q8C006 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim35Q8C006 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim35Q8C006 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim35Q8C006 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim35Q8C006 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim35Q8C006 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim35Q8C006 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim35Q8C006 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim35Q8C006 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim35Q8C006 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim35Q8C006 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim35Q8C006 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim35Q8C006 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim35Q8C006 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim35Q8C006 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim35Q8C006 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim35Q8C006 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim35Q8C006 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim35Q8C006 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim35Q8C006 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim35Q8C006 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim35Q8C006 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim35Q8C006 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim35Q8C006 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim35Q8C006 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim35Q8C006 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim35Q8C006 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim35Q8C006 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim35Q8C006 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim35Q8C006 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim35Q8C006 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim35Q8C006 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim35Q8C006 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim35Q8C006 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim35Q8C006 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim35Q8C006 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim35Q8C006 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim35Q8C006 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim35Q8C006 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim35Q8C006 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim35Q8C006 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim35Q8C006 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim35Q8C006 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim35Q8C006 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim35Q8C006 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim35Q8C006 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim35Q8C006 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim35Q8C006 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim35Q8C006 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim35Q8C006 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim35Q8C006 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trim35Q8C006 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trim35Q8C006 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trim35Q8C006 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim35Q8C006 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim35Q8C006 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim35Q8C006 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim35Q8C006 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim35Q8C006 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim35Q8C006 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim35Q8C006 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim35Q8C006 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim35Q8C006 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim35Q8C006 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim35Q8C006 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim35Q8C006 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim35Q8C006 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim35Q8C006 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim35Q8C006 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Trim35Q8C006 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Trim35Q8C006 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim35Q8C006 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim35Q8C006 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim35Q8C006 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim35Q8C006 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim35Q8C006 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim35Q8C006 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim35Q8C006 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim35Q8C006 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim35Q8C006 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim35Q8C006 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim35Q8C006 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim35Q8C006 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim35Q8C006 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim35Q8C006 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim35Q8C006 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim35Q8C006 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim35Q8C006 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim35Q8C006 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim35Q8C006 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
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