Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUD0

Gpr4, G-protein coupled receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr4Q8BUD0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gpr4Q8BUD0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gpr4Q8BUD0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gpr4Q8BUD0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gpr4Q8BUD0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gpr4Q8BUD0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gpr4Q8BUD0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gpr4Q8BUD0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gpr4Q8BUD0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gpr4Q8BUD0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gpr4Q8BUD0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gpr4Q8BUD0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gpr4Q8BUD0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gpr4Q8BUD0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gpr4Q8BUD0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gpr4Q8BUD0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gpr4Q8BUD0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gpr4Q8BUD0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gpr4Q8BUD0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gpr4Q8BUD0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Gpr4Q8BUD0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gpr4Q8BUD0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpr4Q8BUD0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpr4Q8BUD0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpr4Q8BUD0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpr4Q8BUD0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gpr4Q8BUD0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gpr4Q8BUD0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gpr4Q8BUD0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gpr4Q8BUD0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gpr4Q8BUD0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gpr4Q8BUD0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpr4Q8BUD0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpr4Q8BUD0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpr4Q8BUD0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpr4Q8BUD0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpr4Q8BUD0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpr4Q8BUD0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpr4Q8BUD0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gpr4Q8BUD0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gpr4Q8BUD0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gpr4Q8BUD0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpr4Q8BUD0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpr4Q8BUD0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpr4Q8BUD0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gpr4Q8BUD0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gpr4Q8BUD0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gpr4Q8BUD0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gpr4Q8BUD0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gpr4Q8BUD0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gpr4Q8BUD0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpr4Q8BUD0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpr4Q8BUD0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpr4Q8BUD0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpr4Q8BUD0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gpr4Q8BUD0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gpr4Q8BUD0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gpr4Q8BUD0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gpr4Q8BUD0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gpr4Q8BUD0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gpr4Q8BUD0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gpr4Q8BUD0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gpr4Q8BUD0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gpr4Q8BUD0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gpr4Q8BUD0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gpr4Q8BUD0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gpr4Q8BUD0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gpr4Q8BUD0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gpr4Q8BUD0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gpr4Q8BUD0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gpr4Q8BUD0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gpr4Q8BUD0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gpr4Q8BUD0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gpr4Q8BUD0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpr4Q8BUD0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpr4Q8BUD0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpr4Q8BUD0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpr4Q8BUD0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gpr4Q8BUD0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gpr4Q8BUD0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gpr4Q8BUD0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gpr4Q8BUD0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gpr4Q8BUD0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gpr4Q8BUD0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gpr4Q8BUD0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gpr4Q8BUD0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gpr4Q8BUD0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gpr4Q8BUD0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpr4Q8BUD0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpr4Q8BUD0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gpr4Q8BUD0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gpr4Q8BUD0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gpr4Q8BUD0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gpr4Q8BUD0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gpr4Q8BUD0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gpr4Q8BUD0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gpr4Q8BUD0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gpr4Q8BUD0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gpr4Q8BUD0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gpr4Q8BUD0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms