Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLY1

Smoc1, SPARC-related modular calcium-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smoc1Q8BLY1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Smoc1Q8BLY1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Smoc1Q8BLY1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Smoc1Q8BLY1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Smoc1Q8BLY1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Smoc1Q8BLY1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smoc1Q8BLY1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smoc1Q8BLY1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smoc1Q8BLY1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Smoc1Q8BLY1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smoc1Q8BLY1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smoc1Q8BLY1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smoc1Q8BLY1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smoc1Q8BLY1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smoc1Q8BLY1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smoc1Q8BLY1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smoc1Q8BLY1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smoc1Q8BLY1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Smoc1Q8BLY1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Smoc1Q8BLY1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Smoc1Q8BLY1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Smoc1Q8BLY1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Smoc1Q8BLY1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Smoc1Q8BLY1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smoc1Q8BLY1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smoc1Q8BLY1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smoc1Q8BLY1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smoc1Q8BLY1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smoc1Q8BLY1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smoc1Q8BLY1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Smoc1Q8BLY1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smoc1Q8BLY1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smoc1Q8BLY1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smoc1Q8BLY1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smoc1Q8BLY1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Smoc1Q8BLY1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Smoc1Q8BLY1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Smoc1Q8BLY1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Smoc1Q8BLY1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smoc1Q8BLY1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smoc1Q8BLY1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Smoc1Q8BLY1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smoc1Q8BLY1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Smoc1Q8BLY1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smoc1Q8BLY1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smoc1Q8BLY1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smoc1Q8BLY1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smoc1Q8BLY1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smoc1Q8BLY1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smoc1Q8BLY1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smoc1Q8BLY1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smoc1Q8BLY1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smoc1Q8BLY1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smoc1Q8BLY1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smoc1Q8BLY1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smoc1Q8BLY1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smoc1Q8BLY1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smoc1Q8BLY1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smoc1Q8BLY1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smoc1Q8BLY1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Smoc1Q8BLY1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Smoc1Q8BLY1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smoc1Q8BLY1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smoc1Q8BLY1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smoc1Q8BLY1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smoc1Q8BLY1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smoc1Q8BLY1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smoc1Q8BLY1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smoc1Q8BLY1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smoc1Q8BLY1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Smoc1Q8BLY1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smoc1Q8BLY1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smoc1Q8BLY1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Smoc1Q8BLY1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Smoc1Q8BLY1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smoc1Q8BLY1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smoc1Q8BLY1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smoc1Q8BLY1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smoc1Q8BLY1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smoc1Q8BLY1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Smoc1Q8BLY1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smoc1Q8BLY1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smoc1Q8BLY1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Smoc1Q8BLY1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smoc1Q8BLY1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smoc1Q8BLY1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smoc1Q8BLY1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smoc1Q8BLY1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smoc1Q8BLY1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Smoc1Q8BLY1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Smoc1Q8BLY1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smoc1Q8BLY1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smoc1Q8BLY1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smoc1Q8BLY1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smoc1Q8BLY1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smoc1Q8BLY1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smoc1Q8BLY1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smoc1Q8BLY1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smoc1Q8BLY1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smoc1Q8BLY1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms