Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Tnrc6bQ8BKI2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Tnrc6bQ8BKI2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Tnrc6bQ8BKI2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Tnrc6bQ8BKI2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Tnrc6bQ8BKI2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Tnrc6bQ8BKI2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Tnrc6bQ8BKI2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Tnrc6bQ8BKI2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Tnrc6bQ8BKI2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Tnrc6bQ8BKI2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Tnrc6bQ8BKI2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Tnrc6bQ8BKI2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Tnrc6bQ8BKI2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Tnrc6bQ8BKI2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Tnrc6bQ8BKI2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Tnrc6bQ8BKI2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Tnrc6bQ8BKI2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Tnrc6bQ8BKI2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Tnrc6bQ8BKI2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Tnrc6bQ8BKI2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Tnrc6bQ8BKI2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Tnrc6bQ8BKI2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Tnrc6bQ8BKI2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Tnrc6bQ8BKI2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Tnrc6bQ8BKI2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Tnrc6bQ8BKI2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Tnrc6bQ8BKI2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Tnrc6bQ8BKI2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Tnrc6bQ8BKI2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Tnrc6bQ8BKI2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
Tnrc6bQ8BKI2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Tnrc6bQ8BKI2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Tnrc6bQ8BKI2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Tnrc6bQ8BKI2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Tnrc6bQ8BKI2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Tnrc6bQ8BKI2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Tnrc6bQ8BKI2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Tnrc6bQ8BKI2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Tnrc6bQ8BKI2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Tnrc6bQ8BKI2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Tnrc6bQ8BKI2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Tnrc6bQ8BKI2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Tnrc6bQ8BKI2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Tnrc6bQ8BKI2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Tnrc6bQ8BKI2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
Tnrc6bQ8BKI2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Tnrc6bQ8BKI2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Tnrc6bQ8BKI2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Tnrc6bQ8BKI2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Tnrc6bQ8BKI2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Tnrc6bQ8BKI2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Tnrc6bQ8BKI2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Tnrc6bQ8BKI2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Tnrc6bQ8BKI2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
Tnrc6bQ8BKI2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Tnrc6bQ8BKI2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Tnrc6bQ8BKI2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Tnrc6bQ8BKI2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Tnrc6bQ8BKI2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Tnrc6bQ8BKI2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Tnrc6bQ8BKI2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Tnrc6bQ8BKI2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Tnrc6bQ8BKI2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Tnrc6bQ8BKI2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Tnrc6bQ8BKI2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Tnrc6bQ8BKI2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Tnrc6bQ8BKI2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Tnrc6bQ8BKI2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Tnrc6bQ8BKI2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Tnrc6bQ8BKI2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Tnrc6bQ8BKI2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Tnrc6bQ8BKI2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Tnrc6bQ8BKI2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Tnrc6bQ8BKI2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Tnrc6bQ8BKI2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Tnrc6bQ8BKI2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Tnrc6bQ8BKI2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Tnrc6bQ8BKI2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Tnrc6bQ8BKI2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Tnrc6bQ8BKI2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Tnrc6bQ8BKI2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC33.82■■■■□ 3
Tnrc6bQ8BKI2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Tnrc6bQ8BKI2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Tnrc6bQ8BKI2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Tnrc6bQ8BKI2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Tnrc6bQ8BKI2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Tnrc6bQ8BKI2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
Tnrc6bQ8BKI2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Tnrc6bQ8BKI2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Tnrc6bQ8BKI2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Tnrc6bQ8BKI2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Tnrc6bQ8BKI2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Tnrc6bQ8BKI2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Tnrc6bQ8BKI2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
Tnrc6bQ8BKI2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Tnrc6bQ8BKI2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Tnrc6bQ8BKI2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms