Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Usp1Q8BJQ2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Usp1Q8BJQ2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Usp1Q8BJQ2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Usp1Q8BJQ2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Usp1Q8BJQ2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Usp1Q8BJQ2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Usp1Q8BJQ2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Usp1Q8BJQ2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Usp1Q8BJQ2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Usp1Q8BJQ2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Usp1Q8BJQ2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Usp1Q8BJQ2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp1Q8BJQ2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp1Q8BJQ2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp1Q8BJQ2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Usp1Q8BJQ2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Usp1Q8BJQ2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Usp1Q8BJQ2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Usp1Q8BJQ2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Usp1Q8BJQ2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Usp1Q8BJQ2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Usp1Q8BJQ2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Usp1Q8BJQ2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp1Q8BJQ2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp1Q8BJQ2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp1Q8BJQ2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Usp1Q8BJQ2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Usp1Q8BJQ2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Usp1Q8BJQ2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Usp1Q8BJQ2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Usp1Q8BJQ2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Usp1Q8BJQ2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp1Q8BJQ2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp1Q8BJQ2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Usp1Q8BJQ2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Usp1Q8BJQ2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Usp1Q8BJQ2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Usp1Q8BJQ2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Usp1Q8BJQ2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Usp1Q8BJQ2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Usp1Q8BJQ2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Usp1Q8BJQ2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Usp1Q8BJQ2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Usp1Q8BJQ2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp1Q8BJQ2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Usp1Q8BJQ2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Usp1Q8BJQ2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Usp1Q8BJQ2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Usp1Q8BJQ2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Usp1Q8BJQ2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Usp1Q8BJQ2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Usp1Q8BJQ2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Usp1Q8BJQ2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp1Q8BJQ2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp1Q8BJQ2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp1Q8BJQ2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp1Q8BJQ2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp1Q8BJQ2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp1Q8BJQ2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Usp1Q8BJQ2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Usp1Q8BJQ2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp1Q8BJQ2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Usp1Q8BJQ2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Usp1Q8BJQ2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Usp1Q8BJQ2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Usp1Q8BJQ2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Usp1Q8BJQ2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp1Q8BJQ2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Usp1Q8BJQ2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Usp1Q8BJQ2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Usp1Q8BJQ2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Usp1Q8BJQ2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Usp1Q8BJQ2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Usp1Q8BJQ2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Usp1Q8BJQ2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp1Q8BJQ2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp1Q8BJQ2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp1Q8BJQ2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp1Q8BJQ2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp1Q8BJQ2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp1Q8BJQ2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp1Q8BJQ2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp1Q8BJQ2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp1Q8BJQ2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Usp1Q8BJQ2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp1Q8BJQ2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp1Q8BJQ2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp1Q8BJQ2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp1Q8BJQ2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp1Q8BJQ2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp1Q8BJQ2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp1Q8BJQ2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp1Q8BJQ2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp1Q8BJQ2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Usp1Q8BJQ2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Usp1Q8BJQ2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Usp1Q8BJQ2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Usp1Q8BJQ2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp1Q8BJQ2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 627.2 ms