Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ71

Nup93, Nuclear pore complex protein Nup93, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup93Q8BJ71 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nup93Q8BJ71 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nup93Q8BJ71 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nup93Q8BJ71 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Nup93Q8BJ71 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nup93Q8BJ71 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nup93Q8BJ71 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nup93Q8BJ71 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nup93Q8BJ71 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nup93Q8BJ71 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nup93Q8BJ71 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nup93Q8BJ71 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nup93Q8BJ71 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nup93Q8BJ71 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nup93Q8BJ71 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nup93Q8BJ71 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nup93Q8BJ71 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nup93Q8BJ71 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nup93Q8BJ71 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nup93Q8BJ71 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nup93Q8BJ71 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nup93Q8BJ71 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nup93Q8BJ71 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nup93Q8BJ71 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nup93Q8BJ71 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nup93Q8BJ71 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nup93Q8BJ71 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nup93Q8BJ71 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nup93Q8BJ71 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Nup93Q8BJ71 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nup93Q8BJ71 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nup93Q8BJ71 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nup93Q8BJ71 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nup93Q8BJ71 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nup93Q8BJ71 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nup93Q8BJ71 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nup93Q8BJ71 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nup93Q8BJ71 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nup93Q8BJ71 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nup93Q8BJ71 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nup93Q8BJ71 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nup93Q8BJ71 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nup93Q8BJ71 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nup93Q8BJ71 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nup93Q8BJ71 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nup93Q8BJ71 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nup93Q8BJ71 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nup93Q8BJ71 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nup93Q8BJ71 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nup93Q8BJ71 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nup93Q8BJ71 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Nup93Q8BJ71 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Nup93Q8BJ71 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nup93Q8BJ71 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nup93Q8BJ71 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nup93Q8BJ71 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nup93Q8BJ71 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nup93Q8BJ71 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nup93Q8BJ71 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nup93Q8BJ71 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nup93Q8BJ71 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nup93Q8BJ71 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nup93Q8BJ71 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nup93Q8BJ71 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nup93Q8BJ71 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nup93Q8BJ71 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nup93Q8BJ71 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nup93Q8BJ71 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nup93Q8BJ71 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Nup93Q8BJ71 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nup93Q8BJ71 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nup93Q8BJ71 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nup93Q8BJ71 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nup93Q8BJ71 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nup93Q8BJ71 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nup93Q8BJ71 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nup93Q8BJ71 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nup93Q8BJ71 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nup93Q8BJ71 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nup93Q8BJ71 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nup93Q8BJ71 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nup93Q8BJ71 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nup93Q8BJ71 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Nup93Q8BJ71 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nup93Q8BJ71 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nup93Q8BJ71 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Nup93Q8BJ71 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nup93Q8BJ71 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Nup93Q8BJ71 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nup93Q8BJ71 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nup93Q8BJ71 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Nup93Q8BJ71 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nup93Q8BJ71 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nup93Q8BJ71 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nup93Q8BJ71 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Nup93Q8BJ71 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nup93Q8BJ71 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nup93Q8BJ71 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nup93Q8BJ71 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nup93Q8BJ71 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms