Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH74

Nup107, Nuclear pore complex protein Nup107, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup107Q8BH74 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup107Q8BH74 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup107Q8BH74 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup107Q8BH74 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup107Q8BH74 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup107Q8BH74 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup107Q8BH74 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup107Q8BH74 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup107Q8BH74 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup107Q8BH74 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup107Q8BH74 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup107Q8BH74 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nup107Q8BH74 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nup107Q8BH74 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup107Q8BH74 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nup107Q8BH74 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nup107Q8BH74 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nup107Q8BH74 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Nup107Q8BH74 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nup107Q8BH74 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nup107Q8BH74 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nup107Q8BH74 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nup107Q8BH74 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nup107Q8BH74 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nup107Q8BH74 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nup107Q8BH74 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nup107Q8BH74 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Nup107Q8BH74 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nup107Q8BH74 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nup107Q8BH74 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nup107Q8BH74 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nup107Q8BH74 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nup107Q8BH74 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nup107Q8BH74 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nup107Q8BH74 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nup107Q8BH74 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nup107Q8BH74 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nup107Q8BH74 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nup107Q8BH74 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nup107Q8BH74 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nup107Q8BH74 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nup107Q8BH74 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup107Q8BH74 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup107Q8BH74 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup107Q8BH74 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup107Q8BH74 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup107Q8BH74 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup107Q8BH74 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup107Q8BH74 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup107Q8BH74 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup107Q8BH74 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nup107Q8BH74 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nup107Q8BH74 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nup107Q8BH74 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup107Q8BH74 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup107Q8BH74 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup107Q8BH74 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup107Q8BH74 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nup107Q8BH74 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nup107Q8BH74 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nup107Q8BH74 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nup107Q8BH74 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nup107Q8BH74 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nup107Q8BH74 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nup107Q8BH74 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nup107Q8BH74 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Nup107Q8BH74 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nup107Q8BH74 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nup107Q8BH74 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nup107Q8BH74 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nup107Q8BH74 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nup107Q8BH74 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Nup107Q8BH74 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nup107Q8BH74 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nup107Q8BH74 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup107Q8BH74 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup107Q8BH74 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup107Q8BH74 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup107Q8BH74 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup107Q8BH74 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup107Q8BH74 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup107Q8BH74 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup107Q8BH74 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup107Q8BH74 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nup107Q8BH74 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nup107Q8BH74 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nup107Q8BH74 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup107Q8BH74 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup107Q8BH74 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup107Q8BH74 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup107Q8BH74 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nup107Q8BH74 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Nup107Q8BH74 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nup107Q8BH74 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup107Q8BH74 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup107Q8BH74 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup107Q8BH74 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup107Q8BH74 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup107Q8BH74 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup107Q8BH74 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms