Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cyp4f39Q8BGU0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cyp4f39Q8BGU0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cyp4f39Q8BGU0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cyp4f39Q8BGU0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Cyp4f39Q8BGU0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Cyp4f39Q8BGU0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cyp4f39Q8BGU0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cyp4f39Q8BGU0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cyp4f39Q8BGU0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cyp4f39Q8BGU0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cyp4f39Q8BGU0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Cyp4f39Q8BGU0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Cyp4f39Q8BGU0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cyp4f39Q8BGU0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Cyp4f39Q8BGU0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cyp4f39Q8BGU0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cyp4f39Q8BGU0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cyp4f39Q8BGU0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cyp4f39Q8BGU0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Cyp4f39Q8BGU0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cyp4f39Q8BGU0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cyp4f39Q8BGU0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cyp4f39Q8BGU0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cyp4f39Q8BGU0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Cyp4f39Q8BGU0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cyp4f39Q8BGU0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cyp4f39Q8BGU0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cyp4f39Q8BGU0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cyp4f39Q8BGU0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cyp4f39Q8BGU0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cyp4f39Q8BGU0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cyp4f39Q8BGU0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cyp4f39Q8BGU0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Cyp4f39Q8BGU0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cyp4f39Q8BGU0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cyp4f39Q8BGU0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cyp4f39Q8BGU0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cyp4f39Q8BGU0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cyp4f39Q8BGU0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cyp4f39Q8BGU0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cyp4f39Q8BGU0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cyp4f39Q8BGU0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cyp4f39Q8BGU0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cyp4f39Q8BGU0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cyp4f39Q8BGU0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cyp4f39Q8BGU0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cyp4f39Q8BGU0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cyp4f39Q8BGU0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cyp4f39Q8BGU0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cyp4f39Q8BGU0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cyp4f39Q8BGU0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cyp4f39Q8BGU0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cyp4f39Q8BGU0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Cyp4f39Q8BGU0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Cyp4f39Q8BGU0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Cyp4f39Q8BGU0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Cyp4f39Q8BGU0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cyp4f39Q8BGU0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Cyp4f39Q8BGU0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cyp4f39Q8BGU0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cyp4f39Q8BGU0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Cyp4f39Q8BGU0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cyp4f39Q8BGU0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cyp4f39Q8BGU0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cyp4f39Q8BGU0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cyp4f39Q8BGU0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cyp4f39Q8BGU0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cyp4f39Q8BGU0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cyp4f39Q8BGU0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cyp4f39Q8BGU0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cyp4f39Q8BGU0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cyp4f39Q8BGU0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cyp4f39Q8BGU0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cyp4f39Q8BGU0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cyp4f39Q8BGU0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Cyp4f39Q8BGU0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Cyp4f39Q8BGU0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cyp4f39Q8BGU0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cyp4f39Q8BGU0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cyp4f39Q8BGU0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Cyp4f39Q8BGU0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cyp4f39Q8BGU0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cyp4f39Q8BGU0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cyp4f39Q8BGU0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cyp4f39Q8BGU0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Cyp4f39Q8BGU0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cyp4f39Q8BGU0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cyp4f39Q8BGU0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cyp4f39Q8BGU0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cyp4f39Q8BGU0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cyp4f39Q8BGU0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cyp4f39Q8BGU0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cyp4f39Q8BGU0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cyp4f39Q8BGU0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cyp4f39Q8BGU0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cyp4f39Q8BGU0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms