Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Vipas39Q8BGQ1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Vipas39Q8BGQ1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Vipas39Q8BGQ1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Vipas39Q8BGQ1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Vipas39Q8BGQ1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Vipas39Q8BGQ1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Vipas39Q8BGQ1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Vipas39Q8BGQ1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Vipas39Q8BGQ1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Vipas39Q8BGQ1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Vipas39Q8BGQ1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Vipas39Q8BGQ1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Vipas39Q8BGQ1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Vipas39Q8BGQ1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Vipas39Q8BGQ1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Vipas39Q8BGQ1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Vipas39Q8BGQ1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Vipas39Q8BGQ1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Vipas39Q8BGQ1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Vipas39Q8BGQ1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Vipas39Q8BGQ1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vipas39Q8BGQ1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vipas39Q8BGQ1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vipas39Q8BGQ1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vipas39Q8BGQ1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vipas39Q8BGQ1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vipas39Q8BGQ1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vipas39Q8BGQ1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vipas39Q8BGQ1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Vipas39Q8BGQ1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vipas39Q8BGQ1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vipas39Q8BGQ1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Vipas39Q8BGQ1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vipas39Q8BGQ1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Vipas39Q8BGQ1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Vipas39Q8BGQ1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vipas39Q8BGQ1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vipas39Q8BGQ1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vipas39Q8BGQ1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vipas39Q8BGQ1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vipas39Q8BGQ1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vipas39Q8BGQ1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vipas39Q8BGQ1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vipas39Q8BGQ1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vipas39Q8BGQ1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vipas39Q8BGQ1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vipas39Q8BGQ1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vipas39Q8BGQ1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vipas39Q8BGQ1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vipas39Q8BGQ1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vipas39Q8BGQ1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vipas39Q8BGQ1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Vipas39Q8BGQ1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vipas39Q8BGQ1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vipas39Q8BGQ1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vipas39Q8BGQ1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vipas39Q8BGQ1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vipas39Q8BGQ1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vipas39Q8BGQ1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vipas39Q8BGQ1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vipas39Q8BGQ1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Vipas39Q8BGQ1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Vipas39Q8BGQ1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Vipas39Q8BGQ1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vipas39Q8BGQ1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Vipas39Q8BGQ1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Vipas39Q8BGQ1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Vipas39Q8BGQ1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Vipas39Q8BGQ1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Vipas39Q8BGQ1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Vipas39Q8BGQ1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vipas39Q8BGQ1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vipas39Q8BGQ1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Vipas39Q8BGQ1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Vipas39Q8BGQ1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Vipas39Q8BGQ1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vipas39Q8BGQ1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vipas39Q8BGQ1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Vipas39Q8BGQ1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vipas39Q8BGQ1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vipas39Q8BGQ1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vipas39Q8BGQ1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Vipas39Q8BGQ1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Vipas39Q8BGQ1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Vipas39Q8BGQ1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Vipas39Q8BGQ1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Vipas39Q8BGQ1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Vipas39Q8BGQ1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Vipas39Q8BGQ1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Vipas39Q8BGQ1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vipas39Q8BGQ1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vipas39Q8BGQ1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vipas39Q8BGQ1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vipas39Q8BGQ1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Vipas39Q8BGQ1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vipas39Q8BGQ1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vipas39Q8BGQ1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vipas39Q8BGQ1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Vipas39Q8BGQ1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms