Protein–RNA interactions for Protein: Q80W99

Catsper3, Cation channel sperm-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsper3Q80W99 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Catsper3Q80W99 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Catsper3Q80W99 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Catsper3Q80W99 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Catsper3Q80W99 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Catsper3Q80W99 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Catsper3Q80W99 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Catsper3Q80W99 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Catsper3Q80W99 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Catsper3Q80W99 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Catsper3Q80W99 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Catsper3Q80W99 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Catsper3Q80W99 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Catsper3Q80W99 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Catsper3Q80W99 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Catsper3Q80W99 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Catsper3Q80W99 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Catsper3Q80W99 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Catsper3Q80W99 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Catsper3Q80W99 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Catsper3Q80W99 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Catsper3Q80W99 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Catsper3Q80W99 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Catsper3Q80W99 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Catsper3Q80W99 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Catsper3Q80W99 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Catsper3Q80W99 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Catsper3Q80W99 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Catsper3Q80W99 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Catsper3Q80W99 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Catsper3Q80W99 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Catsper3Q80W99 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Catsper3Q80W99 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Catsper3Q80W99 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Catsper3Q80W99 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Catsper3Q80W99 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Catsper3Q80W99 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Catsper3Q80W99 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Catsper3Q80W99 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Catsper3Q80W99 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Catsper3Q80W99 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Catsper3Q80W99 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Catsper3Q80W99 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Catsper3Q80W99 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Catsper3Q80W99 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Catsper3Q80W99 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Catsper3Q80W99 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Catsper3Q80W99 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Catsper3Q80W99 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Catsper3Q80W99 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Catsper3Q80W99 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Catsper3Q80W99 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Catsper3Q80W99 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Catsper3Q80W99 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Catsper3Q80W99 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Catsper3Q80W99 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Catsper3Q80W99 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Catsper3Q80W99 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Catsper3Q80W99 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Catsper3Q80W99 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Catsper3Q80W99 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Catsper3Q80W99 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Catsper3Q80W99 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Catsper3Q80W99 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Catsper3Q80W99 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Catsper3Q80W99 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Catsper3Q80W99 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Catsper3Q80W99 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Catsper3Q80W99 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Catsper3Q80W99 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Catsper3Q80W99 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Catsper3Q80W99 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Catsper3Q80W99 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Catsper3Q80W99 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Catsper3Q80W99 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Catsper3Q80W99 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Catsper3Q80W99 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Catsper3Q80W99 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Catsper3Q80W99 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Catsper3Q80W99 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Catsper3Q80W99 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Catsper3Q80W99 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Catsper3Q80W99 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Catsper3Q80W99 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Catsper3Q80W99 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Catsper3Q80W99 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Catsper3Q80W99 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Catsper3Q80W99 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Catsper3Q80W99 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Catsper3Q80W99 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Catsper3Q80W99 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Catsper3Q80W99 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Catsper3Q80W99 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Catsper3Q80W99 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Catsper3Q80W99 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Catsper3Q80W99 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Catsper3Q80W99 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Catsper3Q80W99 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Catsper3Q80W99 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Catsper3Q80W99 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms