Protein–RNA interactions for Protein: Q80U93

Nup214, Nuclear pore complex protein Nup214, mousemouse

Predictions only

Length 2,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup214Q80U93 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup214Q80U93 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup214Q80U93 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup214Q80U93 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup214Q80U93 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup214Q80U93 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nup214Q80U93 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nup214Q80U93 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Nup214Q80U93 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nup214Q80U93 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nup214Q80U93 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Nup214Q80U93 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nup214Q80U93 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nup214Q80U93 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nup214Q80U93 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nup214Q80U93 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Nup214Q80U93 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nup214Q80U93 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nup214Q80U93 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nup214Q80U93 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nup214Q80U93 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nup214Q80U93 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nup214Q80U93 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup214Q80U93 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup214Q80U93 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup214Q80U93 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup214Q80U93 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup214Q80U93 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nup214Q80U93 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nup214Q80U93 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup214Q80U93 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup214Q80U93 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nup214Q80U93 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nup214Q80U93 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nup214Q80U93 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nup214Q80U93 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup214Q80U93 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup214Q80U93 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup214Q80U93 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup214Q80U93 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup214Q80U93 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup214Q80U93 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup214Q80U93 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup214Q80U93 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup214Q80U93 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup214Q80U93 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup214Q80U93 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup214Q80U93 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup214Q80U93 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup214Q80U93 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup214Q80U93 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup214Q80U93 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup214Q80U93 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup214Q80U93 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup214Q80U93 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup214Q80U93 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nup214Q80U93 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nup214Q80U93 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nup214Q80U93 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup214Q80U93 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup214Q80U93 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup214Q80U93 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nup214Q80U93 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nup214Q80U93 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nup214Q80U93 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nup214Q80U93 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nup214Q80U93 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nup214Q80U93 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Nup214Q80U93 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Nup214Q80U93 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nup214Q80U93 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nup214Q80U93 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nup214Q80U93 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nup214Q80U93 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nup214Q80U93 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nup214Q80U93 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nup214Q80U93 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Nup214Q80U93 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nup214Q80U93 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup214Q80U93 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup214Q80U93 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup214Q80U93 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup214Q80U93 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup214Q80U93 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup214Q80U93 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup214Q80U93 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nup214Q80U93 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup214Q80U93 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup214Q80U93 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup214Q80U93 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup214Q80U93 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup214Q80U93 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup214Q80U93 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nup214Q80U93 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nup214Q80U93 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nup214Q80U93 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nup214Q80U93 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nup214Q80U93 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nup214Q80U93 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nup214Q80U93 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms