Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH3

Znf516, Zinc finger protein 516, mousemouse

Predictions only

Length 1,157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf516Q7TSH3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Znf516Q7TSH3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Znf516Q7TSH3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Znf516Q7TSH3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Znf516Q7TSH3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Znf516Q7TSH3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Znf516Q7TSH3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Znf516Q7TSH3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Znf516Q7TSH3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Znf516Q7TSH3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Znf516Q7TSH3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Znf516Q7TSH3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Znf516Q7TSH3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Znf516Q7TSH3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Znf516Q7TSH3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Znf516Q7TSH3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Znf516Q7TSH3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Znf516Q7TSH3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Znf516Q7TSH3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Znf516Q7TSH3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Znf516Q7TSH3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Znf516Q7TSH3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Znf516Q7TSH3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Znf516Q7TSH3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Znf516Q7TSH3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Znf516Q7TSH3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Znf516Q7TSH3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Znf516Q7TSH3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Znf516Q7TSH3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Znf516Q7TSH3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Znf516Q7TSH3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Znf516Q7TSH3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Znf516Q7TSH3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Znf516Q7TSH3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Znf516Q7TSH3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Znf516Q7TSH3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Znf516Q7TSH3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Znf516Q7TSH3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Znf516Q7TSH3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Znf516Q7TSH3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Znf516Q7TSH3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Znf516Q7TSH3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Znf516Q7TSH3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Znf516Q7TSH3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Znf516Q7TSH3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Znf516Q7TSH3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Znf516Q7TSH3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Znf516Q7TSH3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Znf516Q7TSH3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Znf516Q7TSH3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Znf516Q7TSH3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Znf516Q7TSH3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Znf516Q7TSH3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Znf516Q7TSH3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Znf516Q7TSH3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Znf516Q7TSH3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Znf516Q7TSH3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Znf516Q7TSH3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Znf516Q7TSH3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Znf516Q7TSH3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Znf516Q7TSH3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Znf516Q7TSH3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Znf516Q7TSH3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Znf516Q7TSH3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Znf516Q7TSH3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Znf516Q7TSH3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Znf516Q7TSH3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Znf516Q7TSH3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Znf516Q7TSH3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Znf516Q7TSH3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Znf516Q7TSH3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Znf516Q7TSH3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Znf516Q7TSH3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Znf516Q7TSH3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Znf516Q7TSH3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Znf516Q7TSH3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Znf516Q7TSH3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Znf516Q7TSH3 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Znf516Q7TSH3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Znf516Q7TSH3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Znf516Q7TSH3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Znf516Q7TSH3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Znf516Q7TSH3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Znf516Q7TSH3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Znf516Q7TSH3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Znf516Q7TSH3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Znf516Q7TSH3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Znf516Q7TSH3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Znf516Q7TSH3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Znf516Q7TSH3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Znf516Q7TSH3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Znf516Q7TSH3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Znf516Q7TSH3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Znf516Q7TSH3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Znf516Q7TSH3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Znf516Q7TSH3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Znf516Q7TSH3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Znf516Q7TSH3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Znf516Q7TSH3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Znf516Q7TSH3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms