Protein–RNA interactions for Protein: Q7M764

Usp17le, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein E, mousemouse

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17leQ7M764 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Usp17leQ7M764 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Usp17leQ7M764 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Usp17leQ7M764 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Usp17leQ7M764 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Usp17leQ7M764 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Usp17leQ7M764 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Usp17leQ7M764 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Usp17leQ7M764 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Usp17leQ7M764 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Usp17leQ7M764 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Usp17leQ7M764 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Usp17leQ7M764 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Usp17leQ7M764 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Usp17leQ7M764 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Usp17leQ7M764 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Usp17leQ7M764 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Usp17leQ7M764 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Usp17leQ7M764 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Usp17leQ7M764 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Usp17leQ7M764 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Usp17leQ7M764 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Usp17leQ7M764 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Usp17leQ7M764 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Usp17leQ7M764 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Usp17leQ7M764 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Usp17leQ7M764 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Usp17leQ7M764 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Usp17leQ7M764 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Usp17leQ7M764 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Usp17leQ7M764 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Usp17leQ7M764 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Usp17leQ7M764 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Usp17leQ7M764 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Usp17leQ7M764 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Usp17leQ7M764 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Usp17leQ7M764 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Usp17leQ7M764 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Usp17leQ7M764 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Usp17leQ7M764 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Usp17leQ7M764 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Usp17leQ7M764 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Usp17leQ7M764 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Usp17leQ7M764 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Usp17leQ7M764 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Usp17leQ7M764 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Usp17leQ7M764 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Usp17leQ7M764 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Usp17leQ7M764 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Usp17leQ7M764 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Usp17leQ7M764 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Usp17leQ7M764 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Usp17leQ7M764 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Usp17leQ7M764 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Usp17leQ7M764 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Usp17leQ7M764 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Usp17leQ7M764 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Usp17leQ7M764 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Usp17leQ7M764 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Usp17leQ7M764 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Usp17leQ7M764 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Usp17leQ7M764 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Usp17leQ7M764 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Usp17leQ7M764 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Usp17leQ7M764 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Usp17leQ7M764 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Usp17leQ7M764 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Usp17leQ7M764 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Usp17leQ7M764 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Usp17leQ7M764 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Usp17leQ7M764 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Usp17leQ7M764 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Usp17leQ7M764 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Usp17leQ7M764 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Usp17leQ7M764 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Usp17leQ7M764 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Usp17leQ7M764 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Usp17leQ7M764 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Usp17leQ7M764 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Usp17leQ7M764 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Usp17leQ7M764 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Usp17leQ7M764 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Usp17leQ7M764 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Usp17leQ7M764 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Usp17leQ7M764 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Usp17leQ7M764 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Usp17leQ7M764 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Usp17leQ7M764 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Usp17leQ7M764 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Usp17leQ7M764 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Usp17leQ7M764 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Usp17leQ7M764 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Usp17leQ7M764 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Usp17leQ7M764 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Usp17leQ7M764 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Usp17leQ7M764 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Usp17leQ7M764 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Usp17leQ7M764 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Usp17leQ7M764 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Usp17leQ7M764 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.9 ms