Protein–RNA interactions for Protein: Q7M764

Usp17le, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein E, mousemouse

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17leQ7M764 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Usp17leQ7M764 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Usp17leQ7M764 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Usp17leQ7M764 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Usp17leQ7M764 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Usp17leQ7M764 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Usp17leQ7M764 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Usp17leQ7M764 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Usp17leQ7M764 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Usp17leQ7M764 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Usp17leQ7M764 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Usp17leQ7M764 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Usp17leQ7M764 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Usp17leQ7M764 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Usp17leQ7M764 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Usp17leQ7M764 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Usp17leQ7M764 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Usp17leQ7M764 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Usp17leQ7M764 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Usp17leQ7M764 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Usp17leQ7M764 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Usp17leQ7M764 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Usp17leQ7M764 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Usp17leQ7M764 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Usp17leQ7M764 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Usp17leQ7M764 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Usp17leQ7M764 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Usp17leQ7M764 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Usp17leQ7M764 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Usp17leQ7M764 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Usp17leQ7M764 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Usp17leQ7M764 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Usp17leQ7M764 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Usp17leQ7M764 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Usp17leQ7M764 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Usp17leQ7M764 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Usp17leQ7M764 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Usp17leQ7M764 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Usp17leQ7M764 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Usp17leQ7M764 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Usp17leQ7M764 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Usp17leQ7M764 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Usp17leQ7M764 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Usp17leQ7M764 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Usp17leQ7M764 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Usp17leQ7M764 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Usp17leQ7M764 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Usp17leQ7M764 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Usp17leQ7M764 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Usp17leQ7M764 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Usp17leQ7M764 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Usp17leQ7M764 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Usp17leQ7M764 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Usp17leQ7M764 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Usp17leQ7M764 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Usp17leQ7M764 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Usp17leQ7M764 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Usp17leQ7M764 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Usp17leQ7M764 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Usp17leQ7M764 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Usp17leQ7M764 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Usp17leQ7M764 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Usp17leQ7M764 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Usp17leQ7M764 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Usp17leQ7M764 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Usp17leQ7M764 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Usp17leQ7M764 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Usp17leQ7M764 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Usp17leQ7M764 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Usp17leQ7M764 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Usp17leQ7M764 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Usp17leQ7M764 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Usp17leQ7M764 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Usp17leQ7M764 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Usp17leQ7M764 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Usp17leQ7M764 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Usp17leQ7M764 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Usp17leQ7M764 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Usp17leQ7M764 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Usp17leQ7M764 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Usp17leQ7M764 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Usp17leQ7M764 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Usp17leQ7M764 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Usp17leQ7M764 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Usp17leQ7M764 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Usp17leQ7M764 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Usp17leQ7M764 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Usp17leQ7M764 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Usp17leQ7M764 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Usp17leQ7M764 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Usp17leQ7M764 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Usp17leQ7M764 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Usp17leQ7M764 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Usp17leQ7M764 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Usp17leQ7M764 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Usp17leQ7M764 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Usp17leQ7M764 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Usp17leQ7M764 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Usp17leQ7M764 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Usp17leQ7M764 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms