Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trappc6aQ78XR0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trappc6aQ78XR0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trappc6aQ78XR0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trappc6aQ78XR0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trappc6aQ78XR0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trappc6aQ78XR0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Trappc6aQ78XR0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trappc6aQ78XR0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trappc6aQ78XR0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trappc6aQ78XR0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trappc6aQ78XR0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trappc6aQ78XR0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trappc6aQ78XR0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Trappc6aQ78XR0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Trappc6aQ78XR0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trappc6aQ78XR0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trappc6aQ78XR0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trappc6aQ78XR0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trappc6aQ78XR0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trappc6aQ78XR0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trappc6aQ78XR0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trappc6aQ78XR0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Trappc6aQ78XR0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trappc6aQ78XR0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trappc6aQ78XR0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trappc6aQ78XR0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trappc6aQ78XR0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trappc6aQ78XR0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trappc6aQ78XR0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trappc6aQ78XR0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Trappc6aQ78XR0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Trappc6aQ78XR0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trappc6aQ78XR0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trappc6aQ78XR0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trappc6aQ78XR0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trappc6aQ78XR0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trappc6aQ78XR0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trappc6aQ78XR0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trappc6aQ78XR0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trappc6aQ78XR0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trappc6aQ78XR0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trappc6aQ78XR0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trappc6aQ78XR0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trappc6aQ78XR0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trappc6aQ78XR0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trappc6aQ78XR0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Trappc6aQ78XR0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trappc6aQ78XR0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trappc6aQ78XR0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trappc6aQ78XR0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trappc6aQ78XR0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Trappc6aQ78XR0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trappc6aQ78XR0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trappc6aQ78XR0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trappc6aQ78XR0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trappc6aQ78XR0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trappc6aQ78XR0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trappc6aQ78XR0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trappc6aQ78XR0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trappc6aQ78XR0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trappc6aQ78XR0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trappc6aQ78XR0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trappc6aQ78XR0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trappc6aQ78XR0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trappc6aQ78XR0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trappc6aQ78XR0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trappc6aQ78XR0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trappc6aQ78XR0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trappc6aQ78XR0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trappc6aQ78XR0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trappc6aQ78XR0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trappc6aQ78XR0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trappc6aQ78XR0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trappc6aQ78XR0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trappc6aQ78XR0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trappc6aQ78XR0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trappc6aQ78XR0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trappc6aQ78XR0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trappc6aQ78XR0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trappc6aQ78XR0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trappc6aQ78XR0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Trappc6aQ78XR0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trappc6aQ78XR0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trappc6aQ78XR0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trappc6aQ78XR0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trappc6aQ78XR0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trappc6aQ78XR0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trappc6aQ78XR0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trappc6aQ78XR0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trappc6aQ78XR0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trappc6aQ78XR0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trappc6aQ78XR0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trappc6aQ78XR0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trappc6aQ78XR0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trappc6aQ78XR0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trappc6aQ78XR0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trappc6aQ78XR0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trappc6aQ78XR0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trappc6aQ78XR0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
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