Protein–RNA interactions for Protein: Q76I79

Ssh1, Protein phosphatase Slingshot homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh1Q76I79 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ssh1Q76I79 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ssh1Q76I79 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ssh1Q76I79 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ssh1Q76I79 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ssh1Q76I79 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ssh1Q76I79 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ssh1Q76I79 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ssh1Q76I79 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ssh1Q76I79 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ssh1Q76I79 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ssh1Q76I79 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Ssh1Q76I79 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.29
Ssh1Q76I79 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ssh1Q76I79 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ssh1Q76I79 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ssh1Q76I79 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ssh1Q76I79 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ssh1Q76I79 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ssh1Q76I79 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ssh1Q76I79 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ssh1Q76I79 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ssh1Q76I79 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ssh1Q76I79 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ssh1Q76I79 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ssh1Q76I79 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ssh1Q76I79 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ssh1Q76I79 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ssh1Q76I79 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ssh1Q76I79 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ssh1Q76I79 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ssh1Q76I79 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ssh1Q76I79 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ssh1Q76I79 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ssh1Q76I79 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ssh1Q76I79 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ssh1Q76I79 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ssh1Q76I79 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ssh1Q76I79 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ssh1Q76I79 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Ssh1Q76I79 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ssh1Q76I79 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ssh1Q76I79 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ssh1Q76I79 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ssh1Q76I79 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ssh1Q76I79 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ssh1Q76I79 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ssh1Q76I79 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ssh1Q76I79 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ssh1Q76I79 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ssh1Q76I79 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ssh1Q76I79 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ssh1Q76I79 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ssh1Q76I79 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ssh1Q76I79 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ssh1Q76I79 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ssh1Q76I79 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ssh1Q76I79 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Ssh1Q76I79 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ssh1Q76I79 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Ssh1Q76I79 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ssh1Q76I79 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ssh1Q76I79 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ssh1Q76I79 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ssh1Q76I79 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ssh1Q76I79 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ssh1Q76I79 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ssh1Q76I79 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ssh1Q76I79 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ssh1Q76I79 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ssh1Q76I79 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ssh1Q76I79 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ssh1Q76I79 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ssh1Q76I79 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ssh1Q76I79 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ssh1Q76I79 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ssh1Q76I79 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ssh1Q76I79 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ssh1Q76I79 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ssh1Q76I79 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ssh1Q76I79 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ssh1Q76I79 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ssh1Q76I79 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ssh1Q76I79 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ssh1Q76I79 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ssh1Q76I79 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ssh1Q76I79 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ssh1Q76I79 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ssh1Q76I79 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ssh1Q76I79 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ssh1Q76I79 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ssh1Q76I79 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ssh1Q76I79 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ssh1Q76I79 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ssh1Q76I79 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ssh1Q76I79 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Ssh1Q76I79 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Ssh1Q76I79 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ssh1Q76I79 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ssh1Q76I79 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms