Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPQ6

Pitpnm2, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitpnm2Q6ZPQ6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pitpnm2Q6ZPQ6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Pitpnm2Q6ZPQ6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Pitpnm2Q6ZPQ6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pitpnm2Q6ZPQ6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pitpnm2Q6ZPQ6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pitpnm2Q6ZPQ6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pitpnm2Q6ZPQ6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Pitpnm2Q6ZPQ6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Pitpnm2Q6ZPQ6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
Pitpnm2Q6ZPQ6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Pitpnm2Q6ZPQ6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Pitpnm2Q6ZPQ6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Pitpnm2Q6ZPQ6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Pitpnm2Q6ZPQ6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Pitpnm2Q6ZPQ6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Pitpnm2Q6ZPQ6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Pitpnm2Q6ZPQ6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Pitpnm2Q6ZPQ6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pitpnm2Q6ZPQ6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Pitpnm2Q6ZPQ6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Pitpnm2Q6ZPQ6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Pitpnm2Q6ZPQ6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Pitpnm2Q6ZPQ6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Pitpnm2Q6ZPQ6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Pitpnm2Q6ZPQ6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Pitpnm2Q6ZPQ6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Pitpnm2Q6ZPQ6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Pitpnm2Q6ZPQ6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Pitpnm2Q6ZPQ6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Pitpnm2Q6ZPQ6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pitpnm2Q6ZPQ6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pitpnm2Q6ZPQ6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Pitpnm2Q6ZPQ6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Pitpnm2Q6ZPQ6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Pitpnm2Q6ZPQ6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Pitpnm2Q6ZPQ6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Pitpnm2Q6ZPQ6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Pitpnm2Q6ZPQ6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Pitpnm2Q6ZPQ6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Pitpnm2Q6ZPQ6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Pitpnm2Q6ZPQ6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Pitpnm2Q6ZPQ6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Pitpnm2Q6ZPQ6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Pitpnm2Q6ZPQ6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Pitpnm2Q6ZPQ6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Pitpnm2Q6ZPQ6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Pitpnm2Q6ZPQ6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Pitpnm2Q6ZPQ6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Pitpnm2Q6ZPQ6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pitpnm2Q6ZPQ6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pitpnm2Q6ZPQ6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Pitpnm2Q6ZPQ6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Pitpnm2Q6ZPQ6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Pitpnm2Q6ZPQ6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Pitpnm2Q6ZPQ6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Pitpnm2Q6ZPQ6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Pitpnm2Q6ZPQ6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Pitpnm2Q6ZPQ6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pitpnm2Q6ZPQ6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pitpnm2Q6ZPQ6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pitpnm2Q6ZPQ6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pitpnm2Q6ZPQ6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pitpnm2Q6ZPQ6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pitpnm2Q6ZPQ6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Pitpnm2Q6ZPQ6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Pitpnm2Q6ZPQ6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Pitpnm2Q6ZPQ6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pitpnm2Q6ZPQ6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Pitpnm2Q6ZPQ6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pitpnm2Q6ZPQ6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pitpnm2Q6ZPQ6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pitpnm2Q6ZPQ6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pitpnm2Q6ZPQ6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pitpnm2Q6ZPQ6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pitpnm2Q6ZPQ6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pitpnm2Q6ZPQ6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pitpnm2Q6ZPQ6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pitpnm2Q6ZPQ6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pitpnm2Q6ZPQ6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pitpnm2Q6ZPQ6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pitpnm2Q6ZPQ6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pitpnm2Q6ZPQ6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pitpnm2Q6ZPQ6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Pitpnm2Q6ZPQ6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Pitpnm2Q6ZPQ6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Pitpnm2Q6ZPQ6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pitpnm2Q6ZPQ6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pitpnm2Q6ZPQ6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pitpnm2Q6ZPQ6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pitpnm2Q6ZPQ6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Pitpnm2Q6ZPQ6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Pitpnm2Q6ZPQ6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Pitpnm2Q6ZPQ6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pitpnm2Q6ZPQ6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pitpnm2Q6ZPQ6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pitpnm2Q6ZPQ6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Pitpnm2Q6ZPQ6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pitpnm2Q6ZPQ6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pitpnm2Q6ZPQ6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 157.3 ms