Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPJ3

Ube2o, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme UBE2O, mousemouse

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2oQ6ZPJ3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ube2oQ6ZPJ3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ube2oQ6ZPJ3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ube2oQ6ZPJ3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Ube2oQ6ZPJ3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ube2oQ6ZPJ3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ube2oQ6ZPJ3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Ube2oQ6ZPJ3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ube2oQ6ZPJ3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ube2oQ6ZPJ3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ube2oQ6ZPJ3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Ube2oQ6ZPJ3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ube2oQ6ZPJ3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Ube2oQ6ZPJ3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ube2oQ6ZPJ3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ube2oQ6ZPJ3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Ube2oQ6ZPJ3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Ube2oQ6ZPJ3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ube2oQ6ZPJ3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ube2oQ6ZPJ3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ube2oQ6ZPJ3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ube2oQ6ZPJ3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ube2oQ6ZPJ3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ube2oQ6ZPJ3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Ube2oQ6ZPJ3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ube2oQ6ZPJ3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ube2oQ6ZPJ3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ube2oQ6ZPJ3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ube2oQ6ZPJ3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ube2oQ6ZPJ3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ube2oQ6ZPJ3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ube2oQ6ZPJ3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ube2oQ6ZPJ3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ube2oQ6ZPJ3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ube2oQ6ZPJ3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ube2oQ6ZPJ3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ube2oQ6ZPJ3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ube2oQ6ZPJ3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ube2oQ6ZPJ3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ube2oQ6ZPJ3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ube2oQ6ZPJ3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ube2oQ6ZPJ3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ube2oQ6ZPJ3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Ube2oQ6ZPJ3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ube2oQ6ZPJ3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ube2oQ6ZPJ3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ube2oQ6ZPJ3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Ube2oQ6ZPJ3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ube2oQ6ZPJ3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Ube2oQ6ZPJ3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ube2oQ6ZPJ3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ube2oQ6ZPJ3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ube2oQ6ZPJ3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ube2oQ6ZPJ3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ube2oQ6ZPJ3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Ube2oQ6ZPJ3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ube2oQ6ZPJ3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ube2oQ6ZPJ3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ube2oQ6ZPJ3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ube2oQ6ZPJ3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ube2oQ6ZPJ3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ube2oQ6ZPJ3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ube2oQ6ZPJ3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ube2oQ6ZPJ3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ube2oQ6ZPJ3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ube2oQ6ZPJ3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ube2oQ6ZPJ3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ube2oQ6ZPJ3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ube2oQ6ZPJ3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ube2oQ6ZPJ3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ube2oQ6ZPJ3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ube2oQ6ZPJ3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ube2oQ6ZPJ3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ube2oQ6ZPJ3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ube2oQ6ZPJ3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ube2oQ6ZPJ3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ube2oQ6ZPJ3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ube2oQ6ZPJ3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ube2oQ6ZPJ3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ube2oQ6ZPJ3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Ube2oQ6ZPJ3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ube2oQ6ZPJ3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Ube2oQ6ZPJ3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ube2oQ6ZPJ3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ube2oQ6ZPJ3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ube2oQ6ZPJ3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ube2oQ6ZPJ3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ube2oQ6ZPJ3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ube2oQ6ZPJ3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ube2oQ6ZPJ3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ube2oQ6ZPJ3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ube2oQ6ZPJ3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ube2oQ6ZPJ3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ube2oQ6ZPJ3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ube2oQ6ZPJ3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Ube2oQ6ZPJ3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ube2oQ6ZPJ3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ube2oQ6ZPJ3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ube2oQ6ZPJ3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ube2oQ6ZPJ3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms