Protein–RNA interactions for Protein: Q6VH22

Ift172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift172Q6VH22 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Ift172Q6VH22 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Ift172Q6VH22 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Ift172Q6VH22 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Ift172Q6VH22 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Ift172Q6VH22 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC35.26■■■■□ 3.24
Ift172Q6VH22 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Ift172Q6VH22 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
Ift172Q6VH22 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
Ift172Q6VH22 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Ift172Q6VH22 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
Ift172Q6VH22 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Ift172Q6VH22 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Ift172Q6VH22 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Ift172Q6VH22 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Ift172Q6VH22 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Ift172Q6VH22 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Ift172Q6VH22 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Ift172Q6VH22 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Ift172Q6VH22 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Ift172Q6VH22 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Ift172Q6VH22 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Ift172Q6VH22 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Ift172Q6VH22 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Ift172Q6VH22 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Ift172Q6VH22 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Ift172Q6VH22 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Ift172Q6VH22 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
Ift172Q6VH22 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Ift172Q6VH22 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Ift172Q6VH22 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Ift172Q6VH22 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Ift172Q6VH22 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Ift172Q6VH22 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
Ift172Q6VH22 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Ift172Q6VH22 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Ift172Q6VH22 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Ift172Q6VH22 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Ift172Q6VH22 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Ift172Q6VH22 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
Ift172Q6VH22 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Ift172Q6VH22 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Ift172Q6VH22 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Ift172Q6VH22 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Ift172Q6VH22 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Ift172Q6VH22 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
Ift172Q6VH22 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Ift172Q6VH22 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Ift172Q6VH22 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Ift172Q6VH22 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Ift172Q6VH22 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Ift172Q6VH22 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Ift172Q6VH22 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Ift172Q6VH22 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Ift172Q6VH22 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Ift172Q6VH22 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Ift172Q6VH22 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Ift172Q6VH22 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Ift172Q6VH22 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Ift172Q6VH22 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Ift172Q6VH22 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Ift172Q6VH22 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Ift172Q6VH22 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Ift172Q6VH22 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Ift172Q6VH22 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Ift172Q6VH22 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Ift172Q6VH22 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Ift172Q6VH22 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Ift172Q6VH22 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Ift172Q6VH22 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Ift172Q6VH22 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Ift172Q6VH22 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
Ift172Q6VH22 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Ift172Q6VH22 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Ift172Q6VH22 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Ift172Q6VH22 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Ift172Q6VH22 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
Ift172Q6VH22 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Ift172Q6VH22 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Ift172Q6VH22 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Ift172Q6VH22 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Ift172Q6VH22 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Ift172Q6VH22 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Ift172Q6VH22 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Ift172Q6VH22 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Ift172Q6VH22 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
Ift172Q6VH22 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Ift172Q6VH22 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Ift172Q6VH22 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Ift172Q6VH22 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Ift172Q6VH22 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Ift172Q6VH22 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Ift172Q6VH22 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Ift172Q6VH22 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Ift172Q6VH22 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Ift172Q6VH22 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Ift172Q6VH22 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Ift172Q6VH22 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Ift172Q6VH22 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Ift172Q6VH22 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms