Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ5

Cd300ld3, CMRF35-like molecule 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300ld3Q6SJQ5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cd300ld3Q6SJQ5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cd300ld3Q6SJQ5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd300ld3Q6SJQ5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cd300ld3Q6SJQ5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cd300ld3Q6SJQ5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cd300ld3Q6SJQ5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cd300ld3Q6SJQ5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cd300ld3Q6SJQ5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cd300ld3Q6SJQ5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cd300ld3Q6SJQ5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cd300ld3Q6SJQ5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd300ld3Q6SJQ5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd300ld3Q6SJQ5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd300ld3Q6SJQ5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd300ld3Q6SJQ5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd300ld3Q6SJQ5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd300ld3Q6SJQ5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd300ld3Q6SJQ5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd300ld3Q6SJQ5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd300ld3Q6SJQ5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd300ld3Q6SJQ5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd300ld3Q6SJQ5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd300ld3Q6SJQ5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd300ld3Q6SJQ5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd300ld3Q6SJQ5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd300ld3Q6SJQ5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd300ld3Q6SJQ5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd300ld3Q6SJQ5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd300ld3Q6SJQ5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd300ld3Q6SJQ5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd300ld3Q6SJQ5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd300ld3Q6SJQ5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd300ld3Q6SJQ5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd300ld3Q6SJQ5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd300ld3Q6SJQ5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd300ld3Q6SJQ5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd300ld3Q6SJQ5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd300ld3Q6SJQ5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd300ld3Q6SJQ5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd300ld3Q6SJQ5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd300ld3Q6SJQ5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd300ld3Q6SJQ5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd300ld3Q6SJQ5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd300ld3Q6SJQ5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd300ld3Q6SJQ5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd300ld3Q6SJQ5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd300ld3Q6SJQ5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd300ld3Q6SJQ5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd300ld3Q6SJQ5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd300ld3Q6SJQ5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd300ld3Q6SJQ5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd300ld3Q6SJQ5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd300ld3Q6SJQ5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd300ld3Q6SJQ5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd300ld3Q6SJQ5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd300ld3Q6SJQ5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd300ld3Q6SJQ5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd300ld3Q6SJQ5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd300ld3Q6SJQ5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd300ld3Q6SJQ5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd300ld3Q6SJQ5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd300ld3Q6SJQ5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd300ld3Q6SJQ5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd300ld3Q6SJQ5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cd300ld3Q6SJQ5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd300ld3Q6SJQ5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd300ld3Q6SJQ5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd300ld3Q6SJQ5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd300ld3Q6SJQ5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd300ld3Q6SJQ5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd300ld3Q6SJQ5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd300ld3Q6SJQ5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd300ld3Q6SJQ5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms