Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDQ2

Chd4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd4Q6PDQ2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Chd4Q6PDQ2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Chd4Q6PDQ2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC33.82■■■■□ 3
Chd4Q6PDQ2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Chd4Q6PDQ2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Chd4Q6PDQ2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Chd4Q6PDQ2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Chd4Q6PDQ2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC33.8■■■■□ 3
Chd4Q6PDQ2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
Chd4Q6PDQ2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Chd4Q6PDQ2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC33.78■■■■□ 3
Chd4Q6PDQ2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Chd4Q6PDQ2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Chd4Q6PDQ2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Chd4Q6PDQ2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Chd4Q6PDQ2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Chd4Q6PDQ2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Chd4Q6PDQ2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Chd4Q6PDQ2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Chd4Q6PDQ2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Chd4Q6PDQ2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Chd4Q6PDQ2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Chd4Q6PDQ2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Chd4Q6PDQ2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.98
Chd4Q6PDQ2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Chd4Q6PDQ2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Chd4Q6PDQ2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Chd4Q6PDQ2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Chd4Q6PDQ2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Chd4Q6PDQ2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Chd4Q6PDQ2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Chd4Q6PDQ2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Chd4Q6PDQ2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Chd4Q6PDQ2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Chd4Q6PDQ2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Chd4Q6PDQ2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Chd4Q6PDQ2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Chd4Q6PDQ2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Chd4Q6PDQ2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.97
Chd4Q6PDQ2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Chd4Q6PDQ2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Chd4Q6PDQ2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Chd4Q6PDQ2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Chd4Q6PDQ2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Chd4Q6PDQ2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Chd4Q6PDQ2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Chd4Q6PDQ2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Chd4Q6PDQ2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Chd4Q6PDQ2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Chd4Q6PDQ2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Chd4Q6PDQ2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Chd4Q6PDQ2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Chd4Q6PDQ2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Chd4Q6PDQ2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Chd4Q6PDQ2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Chd4Q6PDQ2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Chd4Q6PDQ2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Chd4Q6PDQ2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Chd4Q6PDQ2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Chd4Q6PDQ2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Chd4Q6PDQ2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Chd4Q6PDQ2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Chd4Q6PDQ2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Chd4Q6PDQ2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Chd4Q6PDQ2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Chd4Q6PDQ2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Chd4Q6PDQ2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Chd4Q6PDQ2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Chd4Q6PDQ2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Chd4Q6PDQ2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Chd4Q6PDQ2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Chd4Q6PDQ2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Chd4Q6PDQ2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Chd4Q6PDQ2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Chd4Q6PDQ2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Chd4Q6PDQ2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Chd4Q6PDQ2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Chd4Q6PDQ2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
Chd4Q6PDQ2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Chd4Q6PDQ2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Chd4Q6PDQ2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Chd4Q6PDQ2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Chd4Q6PDQ2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Chd4Q6PDQ2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Chd4Q6PDQ2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Chd4Q6PDQ2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
Chd4Q6PDQ2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Chd4Q6PDQ2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Chd4Q6PDQ2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Chd4Q6PDQ2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Chd4Q6PDQ2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Chd4Q6PDQ2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Chd4Q6PDQ2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Chd4Q6PDQ2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Chd4Q6PDQ2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Chd4Q6PDQ2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Chd4Q6PDQ2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Chd4Q6PDQ2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Chd4Q6PDQ2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Chd4Q6PDQ2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms