Protein–RNA interactions for Protein: Q6P539

Fam222b, Protein FAM222B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam222bQ6P539 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam222bQ6P539 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam222bQ6P539 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam222bQ6P539 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam222bQ6P539 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam222bQ6P539 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Fam222bQ6P539 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam222bQ6P539 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam222bQ6P539 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam222bQ6P539 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam222bQ6P539 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam222bQ6P539 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam222bQ6P539 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam222bQ6P539 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam222bQ6P539 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam222bQ6P539 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam222bQ6P539 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam222bQ6P539 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam222bQ6P539 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam222bQ6P539 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam222bQ6P539 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam222bQ6P539 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam222bQ6P539 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam222bQ6P539 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam222bQ6P539 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam222bQ6P539 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam222bQ6P539 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam222bQ6P539 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam222bQ6P539 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam222bQ6P539 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam222bQ6P539 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam222bQ6P539 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam222bQ6P539 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fam222bQ6P539 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam222bQ6P539 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam222bQ6P539 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam222bQ6P539 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam222bQ6P539 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam222bQ6P539 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam222bQ6P539 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam222bQ6P539 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam222bQ6P539 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam222bQ6P539 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam222bQ6P539 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam222bQ6P539 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam222bQ6P539 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam222bQ6P539 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Fam222bQ6P539 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam222bQ6P539 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam222bQ6P539 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam222bQ6P539 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam222bQ6P539 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam222bQ6P539 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Fam222bQ6P539 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam222bQ6P539 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fam222bQ6P539 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam222bQ6P539 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam222bQ6P539 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam222bQ6P539 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Fam222bQ6P539 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Fam222bQ6P539 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Fam222bQ6P539 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam222bQ6P539 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam222bQ6P539 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam222bQ6P539 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam222bQ6P539 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam222bQ6P539 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam222bQ6P539 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam222bQ6P539 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam222bQ6P539 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam222bQ6P539 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam222bQ6P539 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam222bQ6P539 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam222bQ6P539 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam222bQ6P539 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam222bQ6P539 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam222bQ6P539 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam222bQ6P539 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam222bQ6P539 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam222bQ6P539 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Fam222bQ6P539 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam222bQ6P539 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam222bQ6P539 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam222bQ6P539 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam222bQ6P539 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam222bQ6P539 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam222bQ6P539 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam222bQ6P539 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam222bQ6P539 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam222bQ6P539 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam222bQ6P539 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam222bQ6P539 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam222bQ6P539 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam222bQ6P539 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam222bQ6P539 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam222bQ6P539 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam222bQ6P539 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam222bQ6P539 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam222bQ6P539 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam222bQ6P539 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms