Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A2

Frg2f1, Expressed sequence AA415398, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg2f1Q6P3A2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Frg2f1Q6P3A2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Frg2f1Q6P3A2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Frg2f1Q6P3A2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Frg2f1Q6P3A2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Frg2f1Q6P3A2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Frg2f1Q6P3A2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Frg2f1Q6P3A2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Frg2f1Q6P3A2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Frg2f1Q6P3A2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Frg2f1Q6P3A2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Frg2f1Q6P3A2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Frg2f1Q6P3A2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Frg2f1Q6P3A2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Frg2f1Q6P3A2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Frg2f1Q6P3A2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Frg2f1Q6P3A2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Frg2f1Q6P3A2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Frg2f1Q6P3A2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Frg2f1Q6P3A2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Frg2f1Q6P3A2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Frg2f1Q6P3A2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Frg2f1Q6P3A2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Frg2f1Q6P3A2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Frg2f1Q6P3A2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Frg2f1Q6P3A2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Frg2f1Q6P3A2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Frg2f1Q6P3A2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Frg2f1Q6P3A2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Frg2f1Q6P3A2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Frg2f1Q6P3A2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Frg2f1Q6P3A2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Frg2f1Q6P3A2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Frg2f1Q6P3A2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Frg2f1Q6P3A2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Frg2f1Q6P3A2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Frg2f1Q6P3A2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Frg2f1Q6P3A2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Frg2f1Q6P3A2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Frg2f1Q6P3A2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Frg2f1Q6P3A2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Frg2f1Q6P3A2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Frg2f1Q6P3A2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Frg2f1Q6P3A2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Frg2f1Q6P3A2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Frg2f1Q6P3A2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Frg2f1Q6P3A2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Frg2f1Q6P3A2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Frg2f1Q6P3A2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Frg2f1Q6P3A2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Frg2f1Q6P3A2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Frg2f1Q6P3A2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Frg2f1Q6P3A2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Frg2f1Q6P3A2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Frg2f1Q6P3A2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Frg2f1Q6P3A2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Frg2f1Q6P3A2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Frg2f1Q6P3A2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Frg2f1Q6P3A2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Frg2f1Q6P3A2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Frg2f1Q6P3A2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Frg2f1Q6P3A2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Frg2f1Q6P3A2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Frg2f1Q6P3A2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Frg2f1Q6P3A2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Frg2f1Q6P3A2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Frg2f1Q6P3A2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Frg2f1Q6P3A2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Frg2f1Q6P3A2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Frg2f1Q6P3A2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Frg2f1Q6P3A2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Frg2f1Q6P3A2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Frg2f1Q6P3A2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Frg2f1Q6P3A2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Frg2f1Q6P3A2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Frg2f1Q6P3A2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Frg2f1Q6P3A2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Frg2f1Q6P3A2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Frg2f1Q6P3A2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Frg2f1Q6P3A2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Frg2f1Q6P3A2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Frg2f1Q6P3A2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Frg2f1Q6P3A2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Frg2f1Q6P3A2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Frg2f1Q6P3A2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Frg2f1Q6P3A2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Frg2f1Q6P3A2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Frg2f1Q6P3A2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frg2f1Q6P3A2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frg2f1Q6P3A2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frg2f1Q6P3A2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frg2f1Q6P3A2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frg2f1Q6P3A2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frg2f1Q6P3A2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frg2f1Q6P3A2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frg2f1Q6P3A2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Frg2f1Q6P3A2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frg2f1Q6P3A2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frg2f1Q6P3A2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frg2f1Q6P3A2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 148.2 ms