Protein–RNA interactions for Protein: Q6P073

Ube2j2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J2, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2j2Q6P073 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ube2j2Q6P073 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ube2j2Q6P073 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ube2j2Q6P073 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ube2j2Q6P073 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ube2j2Q6P073 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ube2j2Q6P073 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ube2j2Q6P073 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ube2j2Q6P073 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ube2j2Q6P073 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ube2j2Q6P073 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ube2j2Q6P073 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ube2j2Q6P073 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ube2j2Q6P073 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ube2j2Q6P073 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ube2j2Q6P073 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ube2j2Q6P073 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ube2j2Q6P073 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ube2j2Q6P073 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ube2j2Q6P073 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ube2j2Q6P073 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ube2j2Q6P073 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ube2j2Q6P073 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ube2j2Q6P073 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ube2j2Q6P073 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ube2j2Q6P073 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ube2j2Q6P073 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ube2j2Q6P073 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ube2j2Q6P073 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ube2j2Q6P073 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube2j2Q6P073 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube2j2Q6P073 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ube2j2Q6P073 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ube2j2Q6P073 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ube2j2Q6P073 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ube2j2Q6P073 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ube2j2Q6P073 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ube2j2Q6P073 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ube2j2Q6P073 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ube2j2Q6P073 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ube2j2Q6P073 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ube2j2Q6P073 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ube2j2Q6P073 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ube2j2Q6P073 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ube2j2Q6P073 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ube2j2Q6P073 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ube2j2Q6P073 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ube2j2Q6P073 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube2j2Q6P073 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube2j2Q6P073 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube2j2Q6P073 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube2j2Q6P073 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube2j2Q6P073 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ube2j2Q6P073 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ube2j2Q6P073 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ube2j2Q6P073 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ube2j2Q6P073 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ube2j2Q6P073 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ube2j2Q6P073 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ube2j2Q6P073 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ube2j2Q6P073 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ube2j2Q6P073 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ube2j2Q6P073 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ube2j2Q6P073 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ube2j2Q6P073 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ube2j2Q6P073 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube2j2Q6P073 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube2j2Q6P073 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ube2j2Q6P073 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ube2j2Q6P073 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ube2j2Q6P073 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ube2j2Q6P073 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ube2j2Q6P073 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ube2j2Q6P073 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ube2j2Q6P073 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ube2j2Q6P073 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ube2j2Q6P073 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ube2j2Q6P073 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ube2j2Q6P073 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ube2j2Q6P073 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ube2j2Q6P073 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ube2j2Q6P073 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ube2j2Q6P073 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ube2j2Q6P073 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ube2j2Q6P073 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ube2j2Q6P073 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ube2j2Q6P073 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ube2j2Q6P073 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ube2j2Q6P073 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ube2j2Q6P073 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ube2j2Q6P073 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ube2j2Q6P073 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ube2j2Q6P073 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ube2j2Q6P073 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ube2j2Q6P073 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ube2j2Q6P073 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ube2j2Q6P073 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ube2j2Q6P073 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ube2j2Q6P073 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ube2j2Q6P073 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms