Protein–RNA interactions for Protein: Q6GSS7

Hist2h2aa1, Histone H2A type 2-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Hist2h2aa1Q6GSS7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hist2h2aa1Q6GSS7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hist2h2aa1Q6GSS7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hist2h2aa1Q6GSS7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hist2h2aa1Q6GSS7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hist2h2aa1Q6GSS7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hist2h2aa1Q6GSS7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hist2h2aa1Q6GSS7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hist2h2aa1Q6GSS7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hist2h2aa1Q6GSS7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hist2h2aa1Q6GSS7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hist2h2aa1Q6GSS7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hist2h2aa1Q6GSS7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hist2h2aa1Q6GSS7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hist2h2aa1Q6GSS7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hist2h2aa1Q6GSS7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hist2h2aa1Q6GSS7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hist2h2aa1Q6GSS7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hist2h2aa1Q6GSS7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hist2h2aa1Q6GSS7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hist2h2aa1Q6GSS7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hist2h2aa1Q6GSS7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hist2h2aa1Q6GSS7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Hist2h2aa1Q6GSS7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hist2h2aa1Q6GSS7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hist2h2aa1Q6GSS7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hist2h2aa1Q6GSS7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Hist2h2aa1Q6GSS7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hist2h2aa1Q6GSS7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hist2h2aa1Q6GSS7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hist2h2aa1Q6GSS7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hist2h2aa1Q6GSS7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hist2h2aa1Q6GSS7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hist2h2aa1Q6GSS7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hist2h2aa1Q6GSS7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hist2h2aa1Q6GSS7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hist2h2aa1Q6GSS7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hist2h2aa1Q6GSS7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hist2h2aa1Q6GSS7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hist2h2aa1Q6GSS7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hist2h2aa1Q6GSS7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Hist2h2aa1Q6GSS7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hist2h2aa1Q6GSS7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hist2h2aa1Q6GSS7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hist2h2aa1Q6GSS7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hist2h2aa1Q6GSS7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hist2h2aa1Q6GSS7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hist2h2aa1Q6GSS7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hist2h2aa1Q6GSS7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Hist2h2aa1Q6GSS7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Hist2h2aa1Q6GSS7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hist2h2aa1Q6GSS7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms