Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQV1

Fam196b, Protein FAM196B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam196bQ6GQV1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Fam196bQ6GQV1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Fam196bQ6GQV1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Fam196bQ6GQV1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Fam196bQ6GQV1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Fam196bQ6GQV1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Fam196bQ6GQV1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Fam196bQ6GQV1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Fam196bQ6GQV1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Fam196bQ6GQV1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Fam196bQ6GQV1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Fam196bQ6GQV1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Fam196bQ6GQV1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Fam196bQ6GQV1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Fam196bQ6GQV1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Fam196bQ6GQV1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Fam196bQ6GQV1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Fam196bQ6GQV1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Fam196bQ6GQV1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Fam196bQ6GQV1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Fam196bQ6GQV1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Fam196bQ6GQV1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Fam196bQ6GQV1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Fam196bQ6GQV1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Fam196bQ6GQV1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Fam196bQ6GQV1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Fam196bQ6GQV1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Fam196bQ6GQV1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Fam196bQ6GQV1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Fam196bQ6GQV1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Fam196bQ6GQV1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Fam196bQ6GQV1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Fam196bQ6GQV1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Fam196bQ6GQV1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Fam196bQ6GQV1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Fam196bQ6GQV1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Fam196bQ6GQV1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Fam196bQ6GQV1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Fam196bQ6GQV1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Fam196bQ6GQV1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Fam196bQ6GQV1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Fam196bQ6GQV1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Fam196bQ6GQV1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Fam196bQ6GQV1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Fam196bQ6GQV1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Fam196bQ6GQV1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Fam196bQ6GQV1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Fam196bQ6GQV1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Fam196bQ6GQV1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Fam196bQ6GQV1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Fam196bQ6GQV1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Fam196bQ6GQV1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Fam196bQ6GQV1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Fam196bQ6GQV1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Fam196bQ6GQV1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Fam196bQ6GQV1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Fam196bQ6GQV1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Fam196bQ6GQV1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Fam196bQ6GQV1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Fam196bQ6GQV1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Fam196bQ6GQV1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Fam196bQ6GQV1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Fam196bQ6GQV1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Fam196bQ6GQV1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Fam196bQ6GQV1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Fam196bQ6GQV1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Fam196bQ6GQV1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Fam196bQ6GQV1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Fam196bQ6GQV1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Fam196bQ6GQV1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Fam196bQ6GQV1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Fam196bQ6GQV1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Fam196bQ6GQV1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Fam196bQ6GQV1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Fam196bQ6GQV1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Fam196bQ6GQV1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Fam196bQ6GQV1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Fam196bQ6GQV1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Fam196bQ6GQV1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Fam196bQ6GQV1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Fam196bQ6GQV1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Fam196bQ6GQV1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Fam196bQ6GQV1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Fam196bQ6GQV1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Fam196bQ6GQV1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Fam196bQ6GQV1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Fam196bQ6GQV1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Fam196bQ6GQV1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Fam196bQ6GQV1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Fam196bQ6GQV1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Fam196bQ6GQV1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Fam196bQ6GQV1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Fam196bQ6GQV1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Fam196bQ6GQV1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Fam196bQ6GQV1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Fam196bQ6GQV1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Fam196bQ6GQV1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Fam196bQ6GQV1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Fam196bQ6GQV1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Fam196bQ6GQV1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms